Protein–RNA interactions for Protein: P36543

ATP6V1E1, V-type proton ATPase subunit E 1, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V1E1P36543 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
ATP6V1E1P36543 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATP6V1E1P36543 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATP6V1E1P36543 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
ATP6V1E1P36543 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATP6V1E1P36543 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATP6V1E1P36543 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATP6V1E1P36543 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATP6V1E1P36543 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATP6V1E1P36543 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATP6V1E1P36543 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATP6V1E1P36543 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATP6V1E1P36543 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATP6V1E1P36543 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATP6V1E1P36543 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATP6V1E1P36543 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATP6V1E1P36543 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATP6V1E1P36543 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATP6V1E1P36543 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATP6V1E1P36543 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATP6V1E1P36543 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATP6V1E1P36543 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATP6V1E1P36543 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATP6V1E1P36543 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATP6V1E1P36543 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
ATP6V1E1P36543 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATP6V1E1P36543 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATP6V1E1P36543 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
ATP6V1E1P36543 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATP6V1E1P36543 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATP6V1E1P36543 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATP6V1E1P36543 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATP6V1E1P36543 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATP6V1E1P36543 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATP6V1E1P36543 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATP6V1E1P36543 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATP6V1E1P36543 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATP6V1E1P36543 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATP6V1E1P36543 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATP6V1E1P36543 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATP6V1E1P36543 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATP6V1E1P36543 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
ATP6V1E1P36543 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATP6V1E1P36543 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATP6V1E1P36543 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP6V1E1P36543 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP6V1E1P36543 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP6V1E1P36543 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP6V1E1P36543 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP6V1E1P36543 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP6V1E1P36543 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP6V1E1P36543 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP6V1E1P36543 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP6V1E1P36543 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP6V1E1P36543 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP6V1E1P36543 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP6V1E1P36543 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP6V1E1P36543 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP6V1E1P36543 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP6V1E1P36543 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP6V1E1P36543 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP6V1E1P36543 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP6V1E1P36543 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP6V1E1P36543 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP6V1E1P36543 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP6V1E1P36543 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP6V1E1P36543 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP6V1E1P36543 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP6V1E1P36543 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP6V1E1P36543 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP6V1E1P36543 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP6V1E1P36543 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP6V1E1P36543 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP6V1E1P36543 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP6V1E1P36543 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP6V1E1P36543 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP6V1E1P36543 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP6V1E1P36543 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP6V1E1P36543 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP6V1E1P36543 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP6V1E1P36543 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP6V1E1P36543 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP6V1E1P36543 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP6V1E1P36543 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP6V1E1P36543 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP6V1E1P36543 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP6V1E1P36543 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP6V1E1P36543 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP6V1E1P36543 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP6V1E1P36543 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP6V1E1P36543 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP6V1E1P36543 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP6V1E1P36543 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP6V1E1P36543 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP6V1E1P36543 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP6V1E1P36543 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP6V1E1P36543 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP6V1E1P36543 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP6V1E1P36543 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP6V1E1P36543 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms