Protein–RNA interactions for Protein: P35221

CTNNA1, Catenin alpha-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA1P35221 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CTNNA1P35221 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CTNNA1P35221 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CTNNA1P35221 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CTNNA1P35221 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CTNNA1P35221 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CTNNA1P35221 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CTNNA1P35221 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CTNNA1P35221 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CTNNA1P35221 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTNNA1P35221 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTNNA1P35221 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTNNA1P35221 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTNNA1P35221 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTNNA1P35221 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTNNA1P35221 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTNNA1P35221 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTNNA1P35221 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTNNA1P35221 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTNNA1P35221 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTNNA1P35221 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTNNA1P35221 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CTNNA1P35221 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTNNA1P35221 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTNNA1P35221 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTNNA1P35221 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTNNA1P35221 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTNNA1P35221 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTNNA1P35221 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTNNA1P35221 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CTNNA1P35221 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTNNA1P35221 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTNNA1P35221 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTNNA1P35221 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTNNA1P35221 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTNNA1P35221 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTNNA1P35221 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CTNNA1P35221 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CTNNA1P35221 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CTNNA1P35221 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CTNNA1P35221 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CTNNA1P35221 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CTNNA1P35221 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CTNNA1P35221 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CTNNA1P35221 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CTNNA1P35221 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CTNNA1P35221 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CTNNA1P35221 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CTNNA1P35221 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CTNNA1P35221 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CTNNA1P35221 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CTNNA1P35221 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CTNNA1P35221 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CTNNA1P35221 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CTNNA1P35221 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CTNNA1P35221 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CTNNA1P35221 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CTNNA1P35221 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CTNNA1P35221 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CTNNA1P35221 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CTNNA1P35221 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CTNNA1P35221 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTNNA1P35221 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTNNA1P35221 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTNNA1P35221 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTNNA1P35221 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTNNA1P35221 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTNNA1P35221 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTNNA1P35221 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTNNA1P35221 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTNNA1P35221 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTNNA1P35221 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTNNA1P35221 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTNNA1P35221 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTNNA1P35221 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CTNNA1P35221 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTNNA1P35221 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTNNA1P35221 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTNNA1P35221 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTNNA1P35221 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTNNA1P35221 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTNNA1P35221 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTNNA1P35221 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTNNA1P35221 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTNNA1P35221 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTNNA1P35221 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTNNA1P35221 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTNNA1P35221 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTNNA1P35221 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTNNA1P35221 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTNNA1P35221 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTNNA1P35221 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTNNA1P35221 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTNNA1P35221 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CTNNA1P35221 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTNNA1P35221 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTNNA1P35221 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CTNNA1P35221 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTNNA1P35221 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTNNA1P35221 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms