Protein–RNA interactions for Protein: P33897

ABCD1, ATP-binding cassette sub-family D member 1, humanhuman

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCD1P33897 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ABCD1P33897 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ABCD1P33897 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ABCD1P33897 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
ABCD1P33897 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
ABCD1P33897 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ABCD1P33897 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
ABCD1P33897 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ABCD1P33897 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
ABCD1P33897 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
ABCD1P33897 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
ABCD1P33897 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
ABCD1P33897 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ABCD1P33897 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ABCD1P33897 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ABCD1P33897 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ABCD1P33897 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ABCD1P33897 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
ABCD1P33897 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ABCD1P33897 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ABCD1P33897 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ABCD1P33897 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ABCD1P33897 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ABCD1P33897 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ABCD1P33897 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ABCD1P33897 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ABCD1P33897 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ABCD1P33897 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ABCD1P33897 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ABCD1P33897 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ABCD1P33897 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ABCD1P33897 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ABCD1P33897 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
ABCD1P33897 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ABCD1P33897 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ABCD1P33897 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ABCD1P33897 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ABCD1P33897 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ABCD1P33897 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ABCD1P33897 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ABCD1P33897 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ABCD1P33897 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ABCD1P33897 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ABCD1P33897 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ABCD1P33897 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ABCD1P33897 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ABCD1P33897 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ABCD1P33897 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ABCD1P33897 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ABCD1P33897 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ABCD1P33897 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ABCD1P33897 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ABCD1P33897 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ABCD1P33897 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
ABCD1P33897 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ABCD1P33897 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ABCD1P33897 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ABCD1P33897 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ABCD1P33897 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ABCD1P33897 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ABCD1P33897 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ABCD1P33897 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ABCD1P33897 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
ABCD1P33897 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ABCD1P33897 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
ABCD1P33897 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ABCD1P33897 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ABCD1P33897 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ABCD1P33897 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ABCD1P33897 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ABCD1P33897 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ABCD1P33897 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ABCD1P33897 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ABCD1P33897 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ABCD1P33897 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ABCD1P33897 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ABCD1P33897 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ABCD1P33897 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
ABCD1P33897 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ABCD1P33897 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ABCD1P33897 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ABCD1P33897 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ABCD1P33897 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ABCD1P33897 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ABCD1P33897 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ABCD1P33897 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
ABCD1P33897 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ABCD1P33897 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ABCD1P33897 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
ABCD1P33897 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ABCD1P33897 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
ABCD1P33897 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ABCD1P33897 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ABCD1P33897 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
ABCD1P33897 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ABCD1P33897 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ABCD1P33897 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ABCD1P33897 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ABCD1P33897 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ABCD1P33897 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms