Protein–RNA interactions for Protein: P32969

RPL9, 60S ribosomal protein L9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL9P32969 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RPL9P32969 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RPL9P32969 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RPL9P32969 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RPL9P32969 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RPL9P32969 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
RPL9P32969 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
RPL9P32969 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RPL9P32969 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
RPL9P32969 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RPL9P32969 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RPL9P32969 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RPL9P32969 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RPL9P32969 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RPL9P32969 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RPL9P32969 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RPL9P32969 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
RPL9P32969 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RPL9P32969 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RPL9P32969 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RPL9P32969 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RPL9P32969 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RPL9P32969 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RPL9P32969 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
RPL9P32969 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RPL9P32969 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RPL9P32969 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RPL9P32969 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RPL9P32969 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RPL9P32969 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RPL9P32969 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RPL9P32969 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RPL9P32969 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RPL9P32969 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RPL9P32969 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RPL9P32969 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RPL9P32969 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RPL9P32969 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RPL9P32969 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RPL9P32969 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RPL9P32969 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RPL9P32969 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RPL9P32969 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RPL9P32969 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RPL9P32969 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RPL9P32969 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RPL9P32969 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RPL9P32969 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RPL9P32969 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RPL9P32969 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RPL9P32969 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RPL9P32969 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RPL9P32969 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RPL9P32969 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RPL9P32969 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RPL9P32969 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RPL9P32969 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RPL9P32969 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RPL9P32969 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
RPL9P32969 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RPL9P32969 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RPL9P32969 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RPL9P32969 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RPL9P32969 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RPL9P32969 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RPL9P32969 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RPL9P32969 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RPL9P32969 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RPL9P32969 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RPL9P32969 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RPL9P32969 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RPL9P32969 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RPL9P32969 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RPL9P32969 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RPL9P32969 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RPL9P32969 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
RPL9P32969 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RPL9P32969 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RPL9P32969 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RPL9P32969 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RPL9P32969 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RPL9P32969 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RPL9P32969 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RPL9P32969 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RPL9P32969 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RPL9P32969 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RPL9P32969 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RPL9P32969 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RPL9P32969 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RPL9P32969 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RPL9P32969 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
RPL9P32969 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RPL9P32969 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RPL9P32969 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RPL9P32969 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RPL9P32969 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RPL9P32969 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RPL9P32969 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RPL9P32969 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RPL9P32969 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms