Protein–RNA interactions for Protein: P32247

BRS3, Bombesin receptor subtype-3, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRS3P32247 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BRS3P32247 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BRS3P32247 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BRS3P32247 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BRS3P32247 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BRS3P32247 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BRS3P32247 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BRS3P32247 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
BRS3P32247 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BRS3P32247 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BRS3P32247 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BRS3P32247 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BRS3P32247 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BRS3P32247 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BRS3P32247 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BRS3P32247 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BRS3P32247 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BRS3P32247 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BRS3P32247 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BRS3P32247 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BRS3P32247 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BRS3P32247 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BRS3P32247 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BRS3P32247 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
BRS3P32247 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BRS3P32247 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BRS3P32247 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BRS3P32247 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BRS3P32247 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BRS3P32247 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BRS3P32247 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BRS3P32247 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BRS3P32247 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BRS3P32247 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
BRS3P32247 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BRS3P32247 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BRS3P32247 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BRS3P32247 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BRS3P32247 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BRS3P32247 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
BRS3P32247 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BRS3P32247 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BRS3P32247 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BRS3P32247 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
BRS3P32247 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
BRS3P32247 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BRS3P32247 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BRS3P32247 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BRS3P32247 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BRS3P32247 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BRS3P32247 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BRS3P32247 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
BRS3P32247 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BRS3P32247 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BRS3P32247 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BRS3P32247 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BRS3P32247 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BRS3P32247 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BRS3P32247 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BRS3P32247 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BRS3P32247 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BRS3P32247 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BRS3P32247 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BRS3P32247 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BRS3P32247 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BRS3P32247 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BRS3P32247 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BRS3P32247 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BRS3P32247 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BRS3P32247 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BRS3P32247 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BRS3P32247 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BRS3P32247 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BRS3P32247 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BRS3P32247 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
BRS3P32247 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
BRS3P32247 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
BRS3P32247 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BRS3P32247 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BRS3P32247 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BRS3P32247 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BRS3P32247 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BRS3P32247 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BRS3P32247 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BRS3P32247 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BRS3P32247 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BRS3P32247 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BRS3P32247 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BRS3P32247 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BRS3P32247 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BRS3P32247 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BRS3P32247 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BRS3P32247 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BRS3P32247 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BRS3P32247 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BRS3P32247 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BRS3P32247 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BRS3P32247 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BRS3P32247 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BRS3P32247 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms