Protein–RNA interactions for Protein: P32246

CCR1, C-C chemokine receptor type 1, humanhuman

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR1P32246 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCR1P32246 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCR1P32246 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCR1P32246 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCR1P32246 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CCR1P32246 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCR1P32246 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCR1P32246 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CCR1P32246 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CCR1P32246 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CCR1P32246 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CCR1P32246 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCR1P32246 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCR1P32246 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CCR1P32246 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCR1P32246 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCR1P32246 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCR1P32246 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCR1P32246 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCR1P32246 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCR1P32246 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCR1P32246 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CCR1P32246 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CCR1P32246 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CCR1P32246 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CCR1P32246 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCR1P32246 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCR1P32246 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCR1P32246 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCR1P32246 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCR1P32246 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCR1P32246 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCR1P32246 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCR1P32246 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCR1P32246 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCR1P32246 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCR1P32246 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCR1P32246 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCR1P32246 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCR1P32246 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCR1P32246 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCR1P32246 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCR1P32246 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCR1P32246 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCR1P32246 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCR1P32246 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCR1P32246 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCR1P32246 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCR1P32246 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCR1P32246 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CCR1P32246 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCR1P32246 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCR1P32246 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCR1P32246 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCR1P32246 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCR1P32246 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCR1P32246 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CCR1P32246 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCR1P32246 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCR1P32246 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCR1P32246 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCR1P32246 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCR1P32246 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCR1P32246 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCR1P32246 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCR1P32246 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCR1P32246 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCR1P32246 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCR1P32246 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCR1P32246 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCR1P32246 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCR1P32246 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCR1P32246 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCR1P32246 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCR1P32246 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCR1P32246 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CCR1P32246 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCR1P32246 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CCR1P32246 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCR1P32246 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCR1P32246 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCR1P32246 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCR1P32246 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCR1P32246 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCR1P32246 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCR1P32246 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCR1P32246 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCR1P32246 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCR1P32246 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CCR1P32246 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCR1P32246 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCR1P32246 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCR1P32246 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCR1P32246 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCR1P32246 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCR1P32246 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCR1P32246 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCR1P32246 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCR1P32246 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCR1P32246 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms