Protein–RNA interactions for Protein: P31268

HOXA7, Homeobox protein Hox-A7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA7P31268 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HOXA7P31268 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
HOXA7P31268 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HOXA7P31268 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
HOXA7P31268 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HOXA7P31268 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
HOXA7P31268 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
HOXA7P31268 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
HOXA7P31268 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HOXA7P31268 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
HOXA7P31268 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HOXA7P31268 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
HOXA7P31268 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
HOXA7P31268 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
HOXA7P31268 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
HOXA7P31268 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
HOXA7P31268 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
HOXA7P31268 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
HOXA7P31268 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
HOXA7P31268 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
HOXA7P31268 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
HOXA7P31268 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
HOXA7P31268 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
HOXA7P31268 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
HOXA7P31268 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
HOXA7P31268 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
HOXA7P31268 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC26.03■■□□□ 1.76
HOXA7P31268 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
HOXA7P31268 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
HOXA7P31268 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
HOXA7P31268 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
HOXA7P31268 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
HOXA7P31268 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
HOXA7P31268 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
HOXA7P31268 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
HOXA7P31268 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
HOXA7P31268 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
HOXA7P31268 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
HOXA7P31268 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
HOXA7P31268 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
HOXA7P31268 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
HOXA7P31268 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
HOXA7P31268 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
HOXA7P31268 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.76
HOXA7P31268 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
HOXA7P31268 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
HOXA7P31268 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
HOXA7P31268 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
HOXA7P31268 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
HOXA7P31268 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC26.01■■□□□ 1.75
HOXA7P31268 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
HOXA7P31268 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
HOXA7P31268 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
HOXA7P31268 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
HOXA7P31268 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
HOXA7P31268 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HOXA7P31268 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HOXA7P31268 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
HOXA7P31268 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
HOXA7P31268 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HOXA7P31268 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
HOXA7P31268 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HOXA7P31268 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HOXA7P31268 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HOXA7P31268 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HOXA7P31268 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC26■■□□□ 1.75
HOXA7P31268 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC26■■□□□ 1.75
HOXA7P31268 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
HOXA7P31268 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HOXA7P31268 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
HOXA7P31268 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HOXA7P31268 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
HOXA7P31268 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
HOXA7P31268 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
HOXA7P31268 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HOXA7P31268 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HOXA7P31268 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HOXA7P31268 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HOXA7P31268 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HOXA7P31268 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HOXA7P31268 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
HOXA7P31268 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
HOXA7P31268 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
HOXA7P31268 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
HOXA7P31268 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
HOXA7P31268 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
HOXA7P31268 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
HOXA7P31268 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
HOXA7P31268 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HOXA7P31268 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
HOXA7P31268 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HOXA7P31268 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HOXA7P31268 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HOXA7P31268 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HOXA7P31268 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HOXA7P31268 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HOXA7P31268 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HOXA7P31268 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HOXA7P31268 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HOXA7P31268 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms