Protein–RNA interactions for Protein: P30307

CDC25C, M-phase inducer phosphatase 3, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC25CP30307 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDC25CP30307 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDC25CP30307 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDC25CP30307 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDC25CP30307 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDC25CP30307 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDC25CP30307 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDC25CP30307 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CDC25CP30307 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDC25CP30307 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDC25CP30307 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CDC25CP30307 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDC25CP30307 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CDC25CP30307 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CDC25CP30307 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CDC25CP30307 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CDC25CP30307 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CDC25CP30307 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDC25CP30307 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDC25CP30307 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CDC25CP30307 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDC25CP30307 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDC25CP30307 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CDC25CP30307 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDC25CP30307 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDC25CP30307 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDC25CP30307 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDC25CP30307 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDC25CP30307 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDC25CP30307 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDC25CP30307 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDC25CP30307 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDC25CP30307 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDC25CP30307 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDC25CP30307 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDC25CP30307 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDC25CP30307 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDC25CP30307 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDC25CP30307 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDC25CP30307 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDC25CP30307 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDC25CP30307 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDC25CP30307 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CDC25CP30307 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDC25CP30307 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDC25CP30307 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDC25CP30307 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDC25CP30307 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CDC25CP30307 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDC25CP30307 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDC25CP30307 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDC25CP30307 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDC25CP30307 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDC25CP30307 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDC25CP30307 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDC25CP30307 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDC25CP30307 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDC25CP30307 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDC25CP30307 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDC25CP30307 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDC25CP30307 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
CDC25CP30307 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
CDC25CP30307 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDC25CP30307 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDC25CP30307 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CDC25CP30307 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDC25CP30307 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDC25CP30307 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDC25CP30307 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDC25CP30307 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDC25CP30307 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDC25CP30307 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDC25CP30307 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CDC25CP30307 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDC25CP30307 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDC25CP30307 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDC25CP30307 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CDC25CP30307 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDC25CP30307 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDC25CP30307 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDC25CP30307 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDC25CP30307 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDC25CP30307 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDC25CP30307 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDC25CP30307 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDC25CP30307 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDC25CP30307 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDC25CP30307 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDC25CP30307 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDC25CP30307 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDC25CP30307 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDC25CP30307 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CDC25CP30307 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDC25CP30307 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDC25CP30307 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDC25CP30307 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDC25CP30307 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CDC25CP30307 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDC25CP30307 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDC25CP30307 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms