Protein–RNA interactions for Protein: P30301

MIP, Lens fiber major intrinsic protein, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIPP30301 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MIPP30301 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MIPP30301 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MIPP30301 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MIPP30301 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MIPP30301 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
MIPP30301 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MIPP30301 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
MIPP30301 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.27■■□□□ 1.31
MIPP30301 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MIPP30301 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MIPP30301 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MIPP30301 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MIPP30301 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MIPP30301 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MIPP30301 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MIPP30301 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MIPP30301 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MIPP30301 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MIPP30301 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MIPP30301 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MIPP30301 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
MIPP30301 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MIPP30301 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MIPP30301 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MIPP30301 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MIPP30301 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MIPP30301 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MIPP30301 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MIPP30301 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MIPP30301 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MIPP30301 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MIPP30301 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MIPP30301 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MIPP30301 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
MIPP30301 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MIPP30301 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MIPP30301 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MIPP30301 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MIPP30301 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MIPP30301 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MIPP30301 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MIPP30301 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MIPP30301 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MIPP30301 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MIPP30301 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MIPP30301 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MIPP30301 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MIPP30301 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MIPP30301 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MIPP30301 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MIPP30301 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MIPP30301 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MIPP30301 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MIPP30301 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MIPP30301 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MIPP30301 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MIPP30301 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MIPP30301 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MIPP30301 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MIPP30301 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MIPP30301 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MIPP30301 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MIPP30301 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MIPP30301 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MIPP30301 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MIPP30301 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MIPP30301 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
MIPP30301 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
MIPP30301 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MIPP30301 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MIPP30301 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MIPP30301 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MIPP30301 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MIPP30301 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MIPP30301 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MIPP30301 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MIPP30301 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MIPP30301 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MIPP30301 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MIPP30301 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MIPP30301 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MIPP30301 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
MIPP30301 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MIPP30301 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MIPP30301 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MIPP30301 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MIPP30301 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MIPP30301 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MIPP30301 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MIPP30301 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MIPP30301 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
MIPP30301 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
MIPP30301 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MIPP30301 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MIPP30301 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MIPP30301 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MIPP30301 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MIPP30301 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MIPP30301 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms