Protein–RNA interactions for Protein: P29536

LMOD1, Leiomodin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 600 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMOD1P29536 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
LMOD1P29536 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
LMOD1P29536 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
LMOD1P29536 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
LMOD1P29536 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
LMOD1P29536 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
LMOD1P29536 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
LMOD1P29536 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
LMOD1P29536 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
LMOD1P29536 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
LMOD1P29536 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
LMOD1P29536 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
LMOD1P29536 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
LMOD1P29536 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
LMOD1P29536 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
LMOD1P29536 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
LMOD1P29536 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
LMOD1P29536 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
LMOD1P29536 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
LMOD1P29536 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
LMOD1P29536 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
LMOD1P29536 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
LMOD1P29536 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
LMOD1P29536 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
LMOD1P29536 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
LMOD1P29536 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
LMOD1P29536 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
LMOD1P29536 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
LMOD1P29536 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
LMOD1P29536 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
LMOD1P29536 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
LMOD1P29536 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
LMOD1P29536 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
LMOD1P29536 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
LMOD1P29536 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
LMOD1P29536 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
LMOD1P29536 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
LMOD1P29536 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
LMOD1P29536 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
LMOD1P29536 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
LMOD1P29536 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
LMOD1P29536 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
LMOD1P29536 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
LMOD1P29536 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
LMOD1P29536 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
LMOD1P29536 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
LMOD1P29536 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
LMOD1P29536 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
LMOD1P29536 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
LMOD1P29536 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
LMOD1P29536 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
LMOD1P29536 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
LMOD1P29536 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
LMOD1P29536 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
LMOD1P29536 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
LMOD1P29536 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
LMOD1P29536 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
LMOD1P29536 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
LMOD1P29536 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
LMOD1P29536 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
LMOD1P29536 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
LMOD1P29536 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
LMOD1P29536 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
LMOD1P29536 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
LMOD1P29536 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
LMOD1P29536 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
LMOD1P29536 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
LMOD1P29536 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
LMOD1P29536 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
LMOD1P29536 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
LMOD1P29536 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
LMOD1P29536 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
LMOD1P29536 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
LMOD1P29536 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
LMOD1P29536 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
LMOD1P29536 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
LMOD1P29536 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
LMOD1P29536 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
LMOD1P29536 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
LMOD1P29536 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
LMOD1P29536 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
LMOD1P29536 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
LMOD1P29536 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
LMOD1P29536 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC27.17■■□□□ 1.94
LMOD1P29536 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
LMOD1P29536 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
LMOD1P29536 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
LMOD1P29536 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
LMOD1P29536 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
LMOD1P29536 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
LMOD1P29536 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
LMOD1P29536 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
LMOD1P29536 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
LMOD1P29536 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
LMOD1P29536 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
LMOD1P29536 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
LMOD1P29536 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
LMOD1P29536 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
LMOD1P29536 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
LMOD1P29536 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms