Protein–RNA interactions for Protein: P29466

CASP1, Caspase-1, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP1P29466 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CASP1P29466 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CASP1P29466 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CASP1P29466 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CASP1P29466 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CASP1P29466 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CASP1P29466 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CASP1P29466 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CASP1P29466 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CASP1P29466 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CASP1P29466 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CASP1P29466 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CASP1P29466 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CASP1P29466 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CASP1P29466 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CASP1P29466 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CASP1P29466 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CASP1P29466 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CASP1P29466 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CASP1P29466 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CASP1P29466 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CASP1P29466 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CASP1P29466 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CASP1P29466 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CASP1P29466 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CASP1P29466 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CASP1P29466 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
CASP1P29466 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CASP1P29466 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CASP1P29466 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CASP1P29466 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CASP1P29466 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CASP1P29466 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CASP1P29466 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CASP1P29466 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CASP1P29466 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CASP1P29466 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CASP1P29466 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CASP1P29466 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CASP1P29466 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CASP1P29466 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CASP1P29466 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CASP1P29466 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CASP1P29466 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CASP1P29466 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CASP1P29466 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CASP1P29466 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CASP1P29466 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CASP1P29466 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CASP1P29466 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CASP1P29466 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CASP1P29466 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CASP1P29466 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CASP1P29466 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CASP1P29466 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CASP1P29466 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CASP1P29466 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CASP1P29466 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CASP1P29466 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CASP1P29466 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CASP1P29466 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CASP1P29466 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CASP1P29466 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CASP1P29466 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CASP1P29466 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CASP1P29466 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CASP1P29466 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CASP1P29466 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CASP1P29466 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CASP1P29466 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CASP1P29466 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CASP1P29466 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CASP1P29466 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CASP1P29466 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CASP1P29466 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CASP1P29466 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CASP1P29466 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CASP1P29466 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CASP1P29466 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CASP1P29466 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CASP1P29466 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CASP1P29466 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CASP1P29466 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CASP1P29466 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CASP1P29466 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
CASP1P29466 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CASP1P29466 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CASP1P29466 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CASP1P29466 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CASP1P29466 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
CASP1P29466 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CASP1P29466 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CASP1P29466 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CASP1P29466 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CASP1P29466 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CASP1P29466 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CASP1P29466 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CASP1P29466 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CASP1P29466 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CASP1P29466 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms