Protein–RNA interactions for Protein: P29374

ARID4A, AT-rich interactive domain-containing protein 4A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID4AP29374 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ARID4AP29374 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ARID4AP29374 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
ARID4AP29374 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ARID4AP29374 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
ARID4AP29374 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ARID4AP29374 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ARID4AP29374 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ARID4AP29374 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ARID4AP29374 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ARID4AP29374 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ARID4AP29374 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ARID4AP29374 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ARID4AP29374 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ARID4AP29374 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ARID4AP29374 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ARID4AP29374 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ARID4AP29374 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
ARID4AP29374 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ARID4AP29374 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ARID4AP29374 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ARID4AP29374 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
ARID4AP29374 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ARID4AP29374 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ARID4AP29374 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ARID4AP29374 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ARID4AP29374 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ARID4AP29374 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ARID4AP29374 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ARID4AP29374 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ARID4AP29374 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ARID4AP29374 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ARID4AP29374 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ARID4AP29374 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ARID4AP29374 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ARID4AP29374 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ARID4AP29374 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ARID4AP29374 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ARID4AP29374 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ARID4AP29374 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ARID4AP29374 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ARID4AP29374 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ARID4AP29374 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ARID4AP29374 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ARID4AP29374 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ARID4AP29374 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ARID4AP29374 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ARID4AP29374 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ARID4AP29374 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
ARID4AP29374 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ARID4AP29374 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ARID4AP29374 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ARID4AP29374 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
ARID4AP29374 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ARID4AP29374 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ARID4AP29374 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
ARID4AP29374 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ARID4AP29374 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ARID4AP29374 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ARID4AP29374 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ARID4AP29374 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ARID4AP29374 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ARID4AP29374 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ARID4AP29374 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ARID4AP29374 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ARID4AP29374 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
ARID4AP29374 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ARID4AP29374 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ARID4AP29374 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ARID4AP29374 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ARID4AP29374 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ARID4AP29374 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ARID4AP29374 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ARID4AP29374 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ARID4AP29374 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ARID4AP29374 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ARID4AP29374 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ARID4AP29374 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ARID4AP29374 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ARID4AP29374 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ARID4AP29374 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ARID4AP29374 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ARID4AP29374 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
ARID4AP29374 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ARID4AP29374 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ARID4AP29374 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ARID4AP29374 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ARID4AP29374 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ARID4AP29374 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ARID4AP29374 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ARID4AP29374 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ARID4AP29374 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ARID4AP29374 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ARID4AP29374 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ARID4AP29374 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ARID4AP29374 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
ARID4AP29374 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ARID4AP29374 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ARID4AP29374 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ARID4AP29374 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms