Protein–RNA interactions for Protein: P29033

GJB2, Gap junction beta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB2P29033 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GJB2P29033 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GJB2P29033 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GJB2P29033 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GJB2P29033 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GJB2P29033 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GJB2P29033 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GJB2P29033 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GJB2P29033 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GJB2P29033 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
GJB2P29033 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GJB2P29033 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GJB2P29033 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GJB2P29033 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GJB2P29033 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GJB2P29033 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GJB2P29033 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
GJB2P29033 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GJB2P29033 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GJB2P29033 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GJB2P29033 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GJB2P29033 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GJB2P29033 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GJB2P29033 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
GJB2P29033 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GJB2P29033 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GJB2P29033 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GJB2P29033 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GJB2P29033 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GJB2P29033 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GJB2P29033 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GJB2P29033 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GJB2P29033 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GJB2P29033 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GJB2P29033 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GJB2P29033 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GJB2P29033 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GJB2P29033 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GJB2P29033 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GJB2P29033 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GJB2P29033 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GJB2P29033 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GJB2P29033 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GJB2P29033 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GJB2P29033 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GJB2P29033 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GJB2P29033 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GJB2P29033 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GJB2P29033 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GJB2P29033 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GJB2P29033 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GJB2P29033 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GJB2P29033 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GJB2P29033 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GJB2P29033 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GJB2P29033 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GJB2P29033 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GJB2P29033 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GJB2P29033 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GJB2P29033 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GJB2P29033 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GJB2P29033 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GJB2P29033 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GJB2P29033 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
GJB2P29033 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
GJB2P29033 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
GJB2P29033 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
GJB2P29033 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
GJB2P29033 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
GJB2P29033 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
GJB2P29033 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
GJB2P29033 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC26■■□□□ 1.75
GJB2P29033 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
GJB2P29033 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GJB2P29033 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
GJB2P29033 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
GJB2P29033 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC26■■□□□ 1.75
GJB2P29033 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GJB2P29033 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GJB2P29033 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
GJB2P29033 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
GJB2P29033 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GJB2P29033 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
GJB2P29033 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC26■■□□□ 1.75
GJB2P29033 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GJB2P29033 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GJB2P29033 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GJB2P29033 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GJB2P29033 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GJB2P29033 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GJB2P29033 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GJB2P29033 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GJB2P29033 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GJB2P29033 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GJB2P29033 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GJB2P29033 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GJB2P29033 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
GJB2P29033 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GJB2P29033 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GJB2P29033 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms