Protein–RNA interactions for Protein: P28749

RBL1, Retinoblastoma-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBL1P28749 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RBL1P28749 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RBL1P28749 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RBL1P28749 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RBL1P28749 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RBL1P28749 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RBL1P28749 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RBL1P28749 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RBL1P28749 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RBL1P28749 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RBL1P28749 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RBL1P28749 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RBL1P28749 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
RBL1P28749 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RBL1P28749 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RBL1P28749 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RBL1P28749 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RBL1P28749 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RBL1P28749 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RBL1P28749 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RBL1P28749 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RBL1P28749 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RBL1P28749 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RBL1P28749 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RBL1P28749 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RBL1P28749 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RBL1P28749 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RBL1P28749 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RBL1P28749 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RBL1P28749 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RBL1P28749 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RBL1P28749 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RBL1P28749 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RBL1P28749 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RBL1P28749 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RBL1P28749 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RBL1P28749 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RBL1P28749 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RBL1P28749 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RBL1P28749 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RBL1P28749 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RBL1P28749 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RBL1P28749 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
RBL1P28749 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RBL1P28749 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RBL1P28749 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RBL1P28749 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RBL1P28749 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RBL1P28749 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RBL1P28749 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RBL1P28749 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RBL1P28749 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RBL1P28749 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RBL1P28749 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RBL1P28749 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RBL1P28749 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RBL1P28749 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RBL1P28749 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RBL1P28749 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RBL1P28749 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RBL1P28749 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RBL1P28749 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RBL1P28749 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RBL1P28749 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RBL1P28749 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RBL1P28749 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RBL1P28749 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RBL1P28749 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RBL1P28749 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RBL1P28749 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RBL1P28749 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RBL1P28749 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RBL1P28749 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RBL1P28749 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
RBL1P28749 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RBL1P28749 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RBL1P28749 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RBL1P28749 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
RBL1P28749 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
RBL1P28749 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RBL1P28749 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RBL1P28749 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RBL1P28749 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RBL1P28749 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RBL1P28749 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RBL1P28749 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RBL1P28749 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RBL1P28749 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RBL1P28749 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RBL1P28749 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RBL1P28749 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RBL1P28749 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RBL1P28749 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RBL1P28749 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RBL1P28749 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RBL1P28749 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RBL1P28749 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RBL1P28749 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RBL1P28749 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RBL1P28749 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms