Protein–RNA interactions for Protein: P28472

GABRB3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRB3P28472 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GABRB3P28472 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GABRB3P28472 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
GABRB3P28472 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GABRB3P28472 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GABRB3P28472 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GABRB3P28472 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GABRB3P28472 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GABRB3P28472 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GABRB3P28472 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GABRB3P28472 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GABRB3P28472 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GABRB3P28472 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GABRB3P28472 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GABRB3P28472 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GABRB3P28472 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GABRB3P28472 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GABRB3P28472 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GABRB3P28472 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GABRB3P28472 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GABRB3P28472 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GABRB3P28472 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GABRB3P28472 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GABRB3P28472 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GABRB3P28472 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GABRB3P28472 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GABRB3P28472 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
GABRB3P28472 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
GABRB3P28472 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GABRB3P28472 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GABRB3P28472 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GABRB3P28472 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GABRB3P28472 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GABRB3P28472 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GABRB3P28472 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GABRB3P28472 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GABRB3P28472 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GABRB3P28472 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GABRB3P28472 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GABRB3P28472 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
GABRB3P28472 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GABRB3P28472 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
GABRB3P28472 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GABRB3P28472 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GABRB3P28472 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GABRB3P28472 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GABRB3P28472 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GABRB3P28472 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GABRB3P28472 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GABRB3P28472 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GABRB3P28472 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GABRB3P28472 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GABRB3P28472 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GABRB3P28472 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GABRB3P28472 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GABRB3P28472 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GABRB3P28472 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GABRB3P28472 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GABRB3P28472 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GABRB3P28472 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GABRB3P28472 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GABRB3P28472 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GABRB3P28472 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GABRB3P28472 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GABRB3P28472 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GABRB3P28472 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GABRB3P28472 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GABRB3P28472 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GABRB3P28472 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GABRB3P28472 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GABRB3P28472 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
GABRB3P28472 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GABRB3P28472 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GABRB3P28472 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GABRB3P28472 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GABRB3P28472 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GABRB3P28472 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GABRB3P28472 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GABRB3P28472 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GABRB3P28472 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GABRB3P28472 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GABRB3P28472 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GABRB3P28472 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GABRB3P28472 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GABRB3P28472 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GABRB3P28472 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GABRB3P28472 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GABRB3P28472 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GABRB3P28472 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GABRB3P28472 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GABRB3P28472 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GABRB3P28472 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GABRB3P28472 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GABRB3P28472 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GABRB3P28472 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GABRB3P28472 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GABRB3P28472 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GABRB3P28472 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GABRB3P28472 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GABRB3P28472 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms