Protein–RNA interactions for Protein: P28074

PSMB5, Proteasome subunit beta type-5, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB5P28074 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PSMB5P28074 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PSMB5P28074 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PSMB5P28074 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PSMB5P28074 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PSMB5P28074 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PSMB5P28074 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PSMB5P28074 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PSMB5P28074 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PSMB5P28074 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PSMB5P28074 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PSMB5P28074 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PSMB5P28074 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PSMB5P28074 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PSMB5P28074 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PSMB5P28074 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PSMB5P28074 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PSMB5P28074 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PSMB5P28074 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PSMB5P28074 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PSMB5P28074 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PSMB5P28074 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PSMB5P28074 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PSMB5P28074 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PSMB5P28074 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PSMB5P28074 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PSMB5P28074 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PSMB5P28074 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PSMB5P28074 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PSMB5P28074 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PSMB5P28074 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PSMB5P28074 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PSMB5P28074 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PSMB5P28074 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PSMB5P28074 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PSMB5P28074 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PSMB5P28074 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PSMB5P28074 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PSMB5P28074 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PSMB5P28074 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PSMB5P28074 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PSMB5P28074 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PSMB5P28074 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PSMB5P28074 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PSMB5P28074 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PSMB5P28074 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PSMB5P28074 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PSMB5P28074 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PSMB5P28074 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PSMB5P28074 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PSMB5P28074 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PSMB5P28074 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PSMB5P28074 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PSMB5P28074 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PSMB5P28074 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PSMB5P28074 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PSMB5P28074 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PSMB5P28074 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PSMB5P28074 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PSMB5P28074 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PSMB5P28074 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PSMB5P28074 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PSMB5P28074 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PSMB5P28074 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PSMB5P28074 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PSMB5P28074 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PSMB5P28074 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PSMB5P28074 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PSMB5P28074 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PSMB5P28074 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PSMB5P28074 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PSMB5P28074 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PSMB5P28074 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PSMB5P28074 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PSMB5P28074 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PSMB5P28074 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PSMB5P28074 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PSMB5P28074 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PSMB5P28074 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PSMB5P28074 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PSMB5P28074 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PSMB5P28074 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PSMB5P28074 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PSMB5P28074 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PSMB5P28074 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PSMB5P28074 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PSMB5P28074 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PSMB5P28074 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PSMB5P28074 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PSMB5P28074 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PSMB5P28074 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PSMB5P28074 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PSMB5P28074 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PSMB5P28074 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PSMB5P28074 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PSMB5P28074 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PSMB5P28074 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PSMB5P28074 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PSMB5P28074 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PSMB5P28074 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms