Protein–RNA interactions for Protein: P27448

MARK3, MAP/microtubule affinity-regulating kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARK3P27448 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MARK3P27448 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MARK3P27448 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MARK3P27448 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MARK3P27448 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MARK3P27448 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MARK3P27448 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MARK3P27448 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MARK3P27448 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MARK3P27448 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MARK3P27448 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MARK3P27448 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MARK3P27448 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MARK3P27448 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MARK3P27448 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MARK3P27448 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MARK3P27448 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MARK3P27448 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MARK3P27448 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MARK3P27448 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
MARK3P27448 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MARK3P27448 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
MARK3P27448 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MARK3P27448 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MARK3P27448 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MARK3P27448 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
MARK3P27448 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MARK3P27448 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
MARK3P27448 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
MARK3P27448 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MARK3P27448 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MARK3P27448 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MARK3P27448 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MARK3P27448 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MARK3P27448 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MARK3P27448 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MARK3P27448 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MARK3P27448 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
MARK3P27448 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MARK3P27448 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MARK3P27448 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MARK3P27448 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MARK3P27448 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
MARK3P27448 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MARK3P27448 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MARK3P27448 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MARK3P27448 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
MARK3P27448 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
MARK3P27448 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
MARK3P27448 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
MARK3P27448 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
MARK3P27448 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
MARK3P27448 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
MARK3P27448 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
MARK3P27448 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
MARK3P27448 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
MARK3P27448 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
MARK3P27448 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
MARK3P27448 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MARK3P27448 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MARK3P27448 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MARK3P27448 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MARK3P27448 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MARK3P27448 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MARK3P27448 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MARK3P27448 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
MARK3P27448 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MARK3P27448 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MARK3P27448 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MARK3P27448 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MARK3P27448 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MARK3P27448 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MARK3P27448 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MARK3P27448 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MARK3P27448 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
MARK3P27448 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MARK3P27448 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MARK3P27448 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MARK3P27448 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MARK3P27448 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MARK3P27448 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MARK3P27448 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MARK3P27448 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
MARK3P27448 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MARK3P27448 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
MARK3P27448 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MARK3P27448 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MARK3P27448 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MARK3P27448 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MARK3P27448 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MARK3P27448 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MARK3P27448 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MARK3P27448 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MARK3P27448 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
MARK3P27448 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MARK3P27448 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MARK3P27448 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MARK3P27448 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MARK3P27448 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MARK3P27448 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.5 ms