Protein–RNA interactions for Protein: P26441

CNTF, Ciliary neurotrophic factor, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTFP26441 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNTFP26441 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNTFP26441 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNTFP26441 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNTFP26441 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNTFP26441 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNTFP26441 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNTFP26441 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNTFP26441 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNTFP26441 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNTFP26441 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNTFP26441 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNTFP26441 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNTFP26441 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNTFP26441 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNTFP26441 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNTFP26441 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNTFP26441 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNTFP26441 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNTFP26441 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNTFP26441 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNTFP26441 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNTFP26441 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CNTFP26441 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNTFP26441 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNTFP26441 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CNTFP26441 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.27■■□□□ 1.15
CNTFP26441 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNTFP26441 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNTFP26441 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNTFP26441 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNTFP26441 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CNTFP26441 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNTFP26441 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNTFP26441 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNTFP26441 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNTFP26441 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNTFP26441 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNTFP26441 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNTFP26441 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNTFP26441 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNTFP26441 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNTFP26441 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNTFP26441 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNTFP26441 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNTFP26441 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNTFP26441 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNTFP26441 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNTFP26441 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNTFP26441 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNTFP26441 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNTFP26441 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNTFP26441 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNTFP26441 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNTFP26441 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNTFP26441 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CNTFP26441 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNTFP26441 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNTFP26441 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNTFP26441 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNTFP26441 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNTFP26441 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNTFP26441 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CNTFP26441 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNTFP26441 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNTFP26441 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNTFP26441 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNTFP26441 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNTFP26441 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNTFP26441 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNTFP26441 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNTFP26441 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNTFP26441 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNTFP26441 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNTFP26441 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNTFP26441 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNTFP26441 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNTFP26441 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNTFP26441 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNTFP26441 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNTFP26441 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNTFP26441 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNTFP26441 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNTFP26441 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNTFP26441 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNTFP26441 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CNTFP26441 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNTFP26441 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNTFP26441 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNTFP26441 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNTFP26441 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNTFP26441 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNTFP26441 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNTFP26441 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNTFP26441 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNTFP26441 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNTFP26441 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNTFP26441 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNTFP26441 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNTFP26441 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms