Protein–RNA interactions for Protein: P26045

PTPN3, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 3, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN3P26045 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPN3P26045 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPN3P26045 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPN3P26045 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPN3P26045 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPN3P26045 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPN3P26045 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPN3P26045 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPN3P26045 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPN3P26045 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPN3P26045 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPN3P26045 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPN3P26045 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPN3P26045 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPN3P26045 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPN3P26045 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPN3P26045 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPN3P26045 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPN3P26045 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPN3P26045 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPN3P26045 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPN3P26045 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPN3P26045 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPN3P26045 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPN3P26045 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPN3P26045 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPN3P26045 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPN3P26045 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPN3P26045 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPN3P26045 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPN3P26045 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPN3P26045 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPN3P26045 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPN3P26045 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPN3P26045 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPN3P26045 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPN3P26045 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPN3P26045 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPN3P26045 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPN3P26045 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPN3P26045 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPN3P26045 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPN3P26045 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPN3P26045 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPN3P26045 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPN3P26045 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPN3P26045 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPN3P26045 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPN3P26045 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPN3P26045 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPN3P26045 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPN3P26045 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPN3P26045 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPN3P26045 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPN3P26045 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPN3P26045 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPN3P26045 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPN3P26045 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPN3P26045 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPN3P26045 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPN3P26045 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPN3P26045 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPN3P26045 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPN3P26045 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPN3P26045 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPN3P26045 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPN3P26045 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPN3P26045 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPN3P26045 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPN3P26045 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPN3P26045 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPN3P26045 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPN3P26045 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPN3P26045 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPN3P26045 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPN3P26045 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPN3P26045 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPN3P26045 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPN3P26045 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPN3P26045 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPN3P26045 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPN3P26045 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PTPN3P26045 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PTPN3P26045 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPN3P26045 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPN3P26045 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPN3P26045 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPN3P26045 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPN3P26045 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPN3P26045 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPN3P26045 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPN3P26045 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPN3P26045 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPN3P26045 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPN3P26045 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPN3P26045 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPN3P26045 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPN3P26045 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPN3P26045 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPN3P26045 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms