Protein–RNA interactions for Protein: P25963

NFKBIA, NF-kappa-B inhibitor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIAP25963 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NFKBIAP25963 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NFKBIAP25963 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NFKBIAP25963 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NFKBIAP25963 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NFKBIAP25963 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NFKBIAP25963 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NFKBIAP25963 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NFKBIAP25963 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NFKBIAP25963 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NFKBIAP25963 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NFKBIAP25963 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NFKBIAP25963 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
NFKBIAP25963 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NFKBIAP25963 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NFKBIAP25963 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NFKBIAP25963 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NFKBIAP25963 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NFKBIAP25963 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NFKBIAP25963 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NFKBIAP25963 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NFKBIAP25963 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NFKBIAP25963 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NFKBIAP25963 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NFKBIAP25963 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NFKBIAP25963 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NFKBIAP25963 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NFKBIAP25963 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NFKBIAP25963 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NFKBIAP25963 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NFKBIAP25963 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NFKBIAP25963 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NFKBIAP25963 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NFKBIAP25963 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
NFKBIAP25963 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NFKBIAP25963 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
NFKBIAP25963 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NFKBIAP25963 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NFKBIAP25963 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NFKBIAP25963 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NFKBIAP25963 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NFKBIAP25963 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NFKBIAP25963 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NFKBIAP25963 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NFKBIAP25963 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NFKBIAP25963 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NFKBIAP25963 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
NFKBIAP25963 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NFKBIAP25963 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NFKBIAP25963 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
NFKBIAP25963 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
NFKBIAP25963 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NFKBIAP25963 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NFKBIAP25963 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NFKBIAP25963 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
NFKBIAP25963 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NFKBIAP25963 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NFKBIAP25963 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NFKBIAP25963 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NFKBIAP25963 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NFKBIAP25963 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NFKBIAP25963 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NFKBIAP25963 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NFKBIAP25963 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NFKBIAP25963 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NFKBIAP25963 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NFKBIAP25963 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NFKBIAP25963 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NFKBIAP25963 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NFKBIAP25963 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NFKBIAP25963 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NFKBIAP25963 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NFKBIAP25963 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NFKBIAP25963 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NFKBIAP25963 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NFKBIAP25963 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NFKBIAP25963 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NFKBIAP25963 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NFKBIAP25963 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NFKBIAP25963 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NFKBIAP25963 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NFKBIAP25963 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NFKBIAP25963 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
NFKBIAP25963 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NFKBIAP25963 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NFKBIAP25963 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NFKBIAP25963 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NFKBIAP25963 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
NFKBIAP25963 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NFKBIAP25963 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NFKBIAP25963 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NFKBIAP25963 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NFKBIAP25963 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
NFKBIAP25963 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
NFKBIAP25963 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
NFKBIAP25963 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NFKBIAP25963 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NFKBIAP25963 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NFKBIAP25963 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NFKBIAP25963 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.4 ms