Protein–RNA interactions for Protein: P25774

CTSS, Cathepsin S, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSSP25774 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CTSSP25774 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
CTSSP25774 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CTSSP25774 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CTSSP25774 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CTSSP25774 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CTSSP25774 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CTSSP25774 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CTSSP25774 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CTSSP25774 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CTSSP25774 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CTSSP25774 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CTSSP25774 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CTSSP25774 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CTSSP25774 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CTSSP25774 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CTSSP25774 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CTSSP25774 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CTSSP25774 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CTSSP25774 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CTSSP25774 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CTSSP25774 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CTSSP25774 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CTSSP25774 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CTSSP25774 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CTSSP25774 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CTSSP25774 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CTSSP25774 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CTSSP25774 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CTSSP25774 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CTSSP25774 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CTSSP25774 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CTSSP25774 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CTSSP25774 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CTSSP25774 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CTSSP25774 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CTSSP25774 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CTSSP25774 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CTSSP25774 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CTSSP25774 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CTSSP25774 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CTSSP25774 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CTSSP25774 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CTSSP25774 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CTSSP25774 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CTSSP25774 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CTSSP25774 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CTSSP25774 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CTSSP25774 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CTSSP25774 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CTSSP25774 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CTSSP25774 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CTSSP25774 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CTSSP25774 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CTSSP25774 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CTSSP25774 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CTSSP25774 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CTSSP25774 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CTSSP25774 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CTSSP25774 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CTSSP25774 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CTSSP25774 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CTSSP25774 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CTSSP25774 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CTSSP25774 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CTSSP25774 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CTSSP25774 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CTSSP25774 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CTSSP25774 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CTSSP25774 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
CTSSP25774 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CTSSP25774 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CTSSP25774 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CTSSP25774 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTSSP25774 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTSSP25774 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTSSP25774 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
CTSSP25774 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTSSP25774 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTSSP25774 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTSSP25774 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTSSP25774 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTSSP25774 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTSSP25774 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTSSP25774 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTSSP25774 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTSSP25774 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTSSP25774 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTSSP25774 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
CTSSP25774 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTSSP25774 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTSSP25774 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTSSP25774 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTSSP25774 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTSSP25774 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTSSP25774 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTSSP25774 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTSSP25774 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTSSP25774 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTSSP25774 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms