Protein–RNA interactions for Protein: P24723

PRKCH, Protein kinase C eta type, humanhuman

Predictions only

Length 683 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCHP24723 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRKCHP24723 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRKCHP24723 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRKCHP24723 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRKCHP24723 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRKCHP24723 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRKCHP24723 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRKCHP24723 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRKCHP24723 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRKCHP24723 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PRKCHP24723 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRKCHP24723 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRKCHP24723 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRKCHP24723 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRKCHP24723 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRKCHP24723 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRKCHP24723 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRKCHP24723 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRKCHP24723 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PRKCHP24723 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PRKCHP24723 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRKCHP24723 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRKCHP24723 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRKCHP24723 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRKCHP24723 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRKCHP24723 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRKCHP24723 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRKCHP24723 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PRKCHP24723 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRKCHP24723 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PRKCHP24723 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRKCHP24723 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRKCHP24723 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PRKCHP24723 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRKCHP24723 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRKCHP24723 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRKCHP24723 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRKCHP24723 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRKCHP24723 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRKCHP24723 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRKCHP24723 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PRKCHP24723 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRKCHP24723 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRKCHP24723 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PRKCHP24723 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRKCHP24723 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRKCHP24723 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRKCHP24723 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRKCHP24723 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRKCHP24723 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PRKCHP24723 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PRKCHP24723 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PRKCHP24723 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRKCHP24723 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRKCHP24723 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRKCHP24723 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRKCHP24723 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRKCHP24723 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRKCHP24723 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRKCHP24723 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PRKCHP24723 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PRKCHP24723 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRKCHP24723 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PRKCHP24723 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRKCHP24723 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRKCHP24723 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRKCHP24723 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRKCHP24723 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRKCHP24723 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRKCHP24723 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRKCHP24723 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRKCHP24723 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRKCHP24723 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRKCHP24723 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PRKCHP24723 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRKCHP24723 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRKCHP24723 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRKCHP24723 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRKCHP24723 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRKCHP24723 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRKCHP24723 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRKCHP24723 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRKCHP24723 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PRKCHP24723 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRKCHP24723 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRKCHP24723 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PRKCHP24723 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRKCHP24723 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRKCHP24723 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PRKCHP24723 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRKCHP24723 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRKCHP24723 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRKCHP24723 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRKCHP24723 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRKCHP24723 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRKCHP24723 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRKCHP24723 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRKCHP24723 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRKCHP24723 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRKCHP24723 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
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