Protein–RNA interactions for Protein: P23588

EIF4B, Eukaryotic translation initiation factor 4B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF4BP23588 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
EIF4BP23588 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
EIF4BP23588 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
EIF4BP23588 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
EIF4BP23588 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
EIF4BP23588 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
EIF4BP23588 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
EIF4BP23588 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
EIF4BP23588 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
EIF4BP23588 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
EIF4BP23588 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
EIF4BP23588 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
EIF4BP23588 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
EIF4BP23588 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
EIF4BP23588 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
EIF4BP23588 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
EIF4BP23588 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
EIF4BP23588 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
EIF4BP23588 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
EIF4BP23588 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
EIF4BP23588 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
EIF4BP23588 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
EIF4BP23588 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
EIF4BP23588 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
EIF4BP23588 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
EIF4BP23588 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
EIF4BP23588 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
EIF4BP23588 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
EIF4BP23588 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
EIF4BP23588 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
EIF4BP23588 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
EIF4BP23588 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
EIF4BP23588 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
EIF4BP23588 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
EIF4BP23588 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
EIF4BP23588 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
EIF4BP23588 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
EIF4BP23588 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
EIF4BP23588 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
EIF4BP23588 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
EIF4BP23588 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
EIF4BP23588 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
EIF4BP23588 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
EIF4BP23588 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
EIF4BP23588 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
EIF4BP23588 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
EIF4BP23588 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
EIF4BP23588 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
EIF4BP23588 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
EIF4BP23588 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
EIF4BP23588 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
EIF4BP23588 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
EIF4BP23588 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
EIF4BP23588 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
EIF4BP23588 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
EIF4BP23588 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
EIF4BP23588 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
EIF4BP23588 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
EIF4BP23588 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
EIF4BP23588 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
EIF4BP23588 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
EIF4BP23588 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
EIF4BP23588 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
EIF4BP23588 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
EIF4BP23588 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
EIF4BP23588 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
EIF4BP23588 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
EIF4BP23588 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
EIF4BP23588 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
EIF4BP23588 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
EIF4BP23588 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
EIF4BP23588 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
EIF4BP23588 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
EIF4BP23588 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
EIF4BP23588 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
EIF4BP23588 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
EIF4BP23588 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
EIF4BP23588 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
EIF4BP23588 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
EIF4BP23588 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
EIF4BP23588 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
EIF4BP23588 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
EIF4BP23588 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
EIF4BP23588 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
EIF4BP23588 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
EIF4BP23588 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
EIF4BP23588 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
EIF4BP23588 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
EIF4BP23588 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
EIF4BP23588 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
EIF4BP23588 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
EIF4BP23588 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
EIF4BP23588 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
EIF4BP23588 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
EIF4BP23588 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
EIF4BP23588 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
EIF4BP23588 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
EIF4BP23588 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
EIF4BP23588 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
EIF4BP23588 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms