Protein–RNA interactions for Protein: P22392

NME2, Nucleoside diphosphate kinase B, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME2P22392 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NME2P22392 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
NME2P22392 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
NME2P22392 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NME2P22392 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NME2P22392 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NME2P22392 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NME2P22392 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NME2P22392 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NME2P22392 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NME2P22392 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NME2P22392 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NME2P22392 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
NME2P22392 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NME2P22392 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NME2P22392 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NME2P22392 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NME2P22392 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
NME2P22392 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NME2P22392 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NME2P22392 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NME2P22392 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NME2P22392 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NME2P22392 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NME2P22392 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NME2P22392 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NME2P22392 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NME2P22392 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
NME2P22392 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NME2P22392 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
NME2P22392 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NME2P22392 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NME2P22392 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NME2P22392 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
NME2P22392 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NME2P22392 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
NME2P22392 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
NME2P22392 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
NME2P22392 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NME2P22392 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NME2P22392 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NME2P22392 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NME2P22392 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NME2P22392 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NME2P22392 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NME2P22392 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NME2P22392 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NME2P22392 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NME2P22392 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NME2P22392 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NME2P22392 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NME2P22392 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NME2P22392 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NME2P22392 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
NME2P22392 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NME2P22392 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NME2P22392 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NME2P22392 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NME2P22392 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NME2P22392 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NME2P22392 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NME2P22392 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NME2P22392 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
NME2P22392 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NME2P22392 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NME2P22392 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NME2P22392 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NME2P22392 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NME2P22392 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NME2P22392 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NME2P22392 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NME2P22392 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NME2P22392 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NME2P22392 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NME2P22392 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NME2P22392 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NME2P22392 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NME2P22392 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NME2P22392 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NME2P22392 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NME2P22392 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NME2P22392 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NME2P22392 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NME2P22392 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NME2P22392 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NME2P22392 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NME2P22392 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NME2P22392 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
NME2P22392 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NME2P22392 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
NME2P22392 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NME2P22392 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NME2P22392 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NME2P22392 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NME2P22392 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NME2P22392 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NME2P22392 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
NME2P22392 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NME2P22392 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NME2P22392 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms