Protein–RNA interactions for Protein: P21810

BGN, Biglycan, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BGNP21810 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BGNP21810 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BGNP21810 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BGNP21810 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BGNP21810 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BGNP21810 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BGNP21810 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BGNP21810 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BGNP21810 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BGNP21810 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BGNP21810 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BGNP21810 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BGNP21810 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BGNP21810 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BGNP21810 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BGNP21810 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BGNP21810 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BGNP21810 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BGNP21810 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BGNP21810 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BGNP21810 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BGNP21810 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BGNP21810 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BGNP21810 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
BGNP21810 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BGNP21810 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
BGNP21810 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BGNP21810 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BGNP21810 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
BGNP21810 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BGNP21810 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
BGNP21810 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BGNP21810 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BGNP21810 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BGNP21810 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BGNP21810 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BGNP21810 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BGNP21810 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BGNP21810 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BGNP21810 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BGNP21810 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BGNP21810 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BGNP21810 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BGNP21810 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BGNP21810 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BGNP21810 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BGNP21810 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BGNP21810 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BGNP21810 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BGNP21810 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BGNP21810 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BGNP21810 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BGNP21810 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BGNP21810 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BGNP21810 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BGNP21810 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BGNP21810 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BGNP21810 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BGNP21810 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BGNP21810 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BGNP21810 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BGNP21810 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BGNP21810 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BGNP21810 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BGNP21810 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BGNP21810 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BGNP21810 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BGNP21810 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
BGNP21810 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BGNP21810 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BGNP21810 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BGNP21810 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BGNP21810 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BGNP21810 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BGNP21810 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BGNP21810 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BGNP21810 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BGNP21810 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BGNP21810 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BGNP21810 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BGNP21810 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BGNP21810 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BGNP21810 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BGNP21810 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BGNP21810 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BGNP21810 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BGNP21810 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BGNP21810 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BGNP21810 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BGNP21810 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BGNP21810 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
BGNP21810 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BGNP21810 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BGNP21810 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BGNP21810 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BGNP21810 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BGNP21810 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BGNP21810 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BGNP21810 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BGNP21810 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms