Protein–RNA interactions for Protein: P20339

RAB5A, Ras-related protein Rab-5A, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB5AP20339 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAB5AP20339 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAB5AP20339 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAB5AP20339 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAB5AP20339 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAB5AP20339 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAB5AP20339 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAB5AP20339 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAB5AP20339 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAB5AP20339 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB5AP20339 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB5AP20339 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB5AP20339 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB5AP20339 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB5AP20339 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB5AP20339 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB5AP20339 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB5AP20339 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB5AP20339 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB5AP20339 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB5AP20339 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB5AP20339 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB5AP20339 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB5AP20339 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB5AP20339 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB5AP20339 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB5AP20339 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB5AP20339 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB5AP20339 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB5AP20339 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB5AP20339 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB5AP20339 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB5AP20339 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB5AP20339 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB5AP20339 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB5AP20339 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB5AP20339 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB5AP20339 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB5AP20339 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB5AP20339 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB5AP20339 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB5AP20339 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB5AP20339 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB5AP20339 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB5AP20339 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB5AP20339 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB5AP20339 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB5AP20339 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB5AP20339 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB5AP20339 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB5AP20339 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB5AP20339 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB5AP20339 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB5AP20339 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB5AP20339 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAB5AP20339 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAB5AP20339 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAB5AP20339 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAB5AP20339 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAB5AP20339 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAB5AP20339 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAB5AP20339 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAB5AP20339 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAB5AP20339 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAB5AP20339 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAB5AP20339 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
RAB5AP20339 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAB5AP20339 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAB5AP20339 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAB5AP20339 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAB5AP20339 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
RAB5AP20339 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
RAB5AP20339 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RAB5AP20339 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
RAB5AP20339 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
RAB5AP20339 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAB5AP20339 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAB5AP20339 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAB5AP20339 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAB5AP20339 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAB5AP20339 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAB5AP20339 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAB5AP20339 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAB5AP20339 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAB5AP20339 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAB5AP20339 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAB5AP20339 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAB5AP20339 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAB5AP20339 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAB5AP20339 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAB5AP20339 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAB5AP20339 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAB5AP20339 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAB5AP20339 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAB5AP20339 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAB5AP20339 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAB5AP20339 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAB5AP20339 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAB5AP20339 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAB5AP20339 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms