Protein–RNA interactions for Protein: P19532

TFE3, Transcription factor E3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFE3P19532 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TFE3P19532 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TFE3P19532 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TFE3P19532 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TFE3P19532 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TFE3P19532 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TFE3P19532 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TFE3P19532 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TFE3P19532 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TFE3P19532 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TFE3P19532 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TFE3P19532 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TFE3P19532 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TFE3P19532 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TFE3P19532 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TFE3P19532 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TFE3P19532 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TFE3P19532 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TFE3P19532 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TFE3P19532 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TFE3P19532 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TFE3P19532 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TFE3P19532 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TFE3P19532 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TFE3P19532 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TFE3P19532 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
TFE3P19532 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TFE3P19532 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TFE3P19532 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TFE3P19532 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TFE3P19532 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TFE3P19532 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TFE3P19532 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TFE3P19532 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TFE3P19532 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
TFE3P19532 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TFE3P19532 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TFE3P19532 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TFE3P19532 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TFE3P19532 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TFE3P19532 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TFE3P19532 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TFE3P19532 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TFE3P19532 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TFE3P19532 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TFE3P19532 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TFE3P19532 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TFE3P19532 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TFE3P19532 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TFE3P19532 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TFE3P19532 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TFE3P19532 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TFE3P19532 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TFE3P19532 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
TFE3P19532 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TFE3P19532 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TFE3P19532 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TFE3P19532 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TFE3P19532 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TFE3P19532 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TFE3P19532 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TFE3P19532 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TFE3P19532 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TFE3P19532 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TFE3P19532 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TFE3P19532 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TFE3P19532 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TFE3P19532 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TFE3P19532 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TFE3P19532 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TFE3P19532 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TFE3P19532 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TFE3P19532 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TFE3P19532 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
TFE3P19532 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TFE3P19532 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TFE3P19532 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
TFE3P19532 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TFE3P19532 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TFE3P19532 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TFE3P19532 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TFE3P19532 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TFE3P19532 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TFE3P19532 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TFE3P19532 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
TFE3P19532 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
TFE3P19532 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TFE3P19532 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TFE3P19532 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TFE3P19532 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TFE3P19532 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TFE3P19532 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TFE3P19532 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TFE3P19532 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TFE3P19532 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TFE3P19532 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TFE3P19532 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TFE3P19532 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TFE3P19532 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TFE3P19532 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms