Protein–RNA interactions for Protein: P18887

XRCC1, DNA repair protein XRCC1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 633 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC1P18887 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
XRCC1P18887 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
XRCC1P18887 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
XRCC1P18887 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
XRCC1P18887 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
XRCC1P18887 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
XRCC1P18887 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
XRCC1P18887 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
XRCC1P18887 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
XRCC1P18887 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
XRCC1P18887 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
XRCC1P18887 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
XRCC1P18887 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
XRCC1P18887 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
XRCC1P18887 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
XRCC1P18887 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
XRCC1P18887 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
XRCC1P18887 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
XRCC1P18887 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
XRCC1P18887 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
XRCC1P18887 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
XRCC1P18887 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
XRCC1P18887 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
XRCC1P18887 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
XRCC1P18887 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
XRCC1P18887 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
XRCC1P18887 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
XRCC1P18887 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
XRCC1P18887 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
XRCC1P18887 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
XRCC1P18887 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
XRCC1P18887 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
XRCC1P18887 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
XRCC1P18887 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
XRCC1P18887 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
XRCC1P18887 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
XRCC1P18887 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
XRCC1P18887 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
XRCC1P18887 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
XRCC1P18887 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
XRCC1P18887 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
XRCC1P18887 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
XRCC1P18887 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
XRCC1P18887 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
XRCC1P18887 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
XRCC1P18887 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
XRCC1P18887 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
XRCC1P18887 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
XRCC1P18887 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
XRCC1P18887 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
XRCC1P18887 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
XRCC1P18887 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
XRCC1P18887 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
XRCC1P18887 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
XRCC1P18887 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
XRCC1P18887 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
XRCC1P18887 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
XRCC1P18887 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
XRCC1P18887 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
XRCC1P18887 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
XRCC1P18887 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
XRCC1P18887 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
XRCC1P18887 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
XRCC1P18887 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
XRCC1P18887 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
XRCC1P18887 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
XRCC1P18887 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
XRCC1P18887 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
XRCC1P18887 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
XRCC1P18887 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
XRCC1P18887 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
XRCC1P18887 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
XRCC1P18887 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
XRCC1P18887 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
XRCC1P18887 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
XRCC1P18887 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
XRCC1P18887 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
XRCC1P18887 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
XRCC1P18887 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
XRCC1P18887 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
XRCC1P18887 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
XRCC1P18887 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
XRCC1P18887 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
XRCC1P18887 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
XRCC1P18887 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
XRCC1P18887 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
XRCC1P18887 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
XRCC1P18887 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
XRCC1P18887 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
XRCC1P18887 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
XRCC1P18887 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
XRCC1P18887 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
XRCC1P18887 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
XRCC1P18887 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
XRCC1P18887 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
XRCC1P18887 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
XRCC1P18887 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
XRCC1P18887 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
XRCC1P18887 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
XRCC1P18887 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms