Protein–RNA interactions for Protein: P18848

ATF4, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF4P18848 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATF4P18848 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATF4P18848 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATF4P18848 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATF4P18848 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATF4P18848 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATF4P18848 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATF4P18848 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATF4P18848 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATF4P18848 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATF4P18848 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATF4P18848 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATF4P18848 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATF4P18848 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATF4P18848 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATF4P18848 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATF4P18848 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATF4P18848 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATF4P18848 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATF4P18848 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATF4P18848 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATF4P18848 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATF4P18848 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATF4P18848 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATF4P18848 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATF4P18848 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATF4P18848 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ATF4P18848 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATF4P18848 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATF4P18848 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATF4P18848 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ATF4P18848 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATF4P18848 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ATF4P18848 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATF4P18848 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATF4P18848 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATF4P18848 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATF4P18848 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATF4P18848 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATF4P18848 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATF4P18848 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATF4P18848 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATF4P18848 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATF4P18848 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATF4P18848 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATF4P18848 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATF4P18848 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATF4P18848 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATF4P18848 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATF4P18848 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATF4P18848 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATF4P18848 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATF4P18848 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATF4P18848 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATF4P18848 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATF4P18848 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATF4P18848 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATF4P18848 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATF4P18848 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATF4P18848 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATF4P18848 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATF4P18848 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATF4P18848 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATF4P18848 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATF4P18848 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATF4P18848 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATF4P18848 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATF4P18848 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATF4P18848 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATF4P18848 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATF4P18848 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATF4P18848 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATF4P18848 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATF4P18848 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATF4P18848 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATF4P18848 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATF4P18848 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATF4P18848 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATF4P18848 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATF4P18848 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATF4P18848 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATF4P18848 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATF4P18848 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATF4P18848 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATF4P18848 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATF4P18848 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATF4P18848 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATF4P18848 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATF4P18848 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ATF4P18848 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATF4P18848 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATF4P18848 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATF4P18848 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATF4P18848 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATF4P18848 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATF4P18848 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATF4P18848 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATF4P18848 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATF4P18848 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATF4P18848 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms