Protein–RNA interactions for Protein: P17812

CTPS1, CTP synthase 1, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1P17812 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTPS1P17812 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTPS1P17812 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTPS1P17812 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTPS1P17812 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CTPS1P17812 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTPS1P17812 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CTPS1P17812 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTPS1P17812 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTPS1P17812 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTPS1P17812 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTPS1P17812 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTPS1P17812 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTPS1P17812 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTPS1P17812 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTPS1P17812 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CTPS1P17812 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTPS1P17812 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CTPS1P17812 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTPS1P17812 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTPS1P17812 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTPS1P17812 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTPS1P17812 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTPS1P17812 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTPS1P17812 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CTPS1P17812 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTPS1P17812 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTPS1P17812 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTPS1P17812 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTPS1P17812 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTPS1P17812 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTPS1P17812 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTPS1P17812 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTPS1P17812 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTPS1P17812 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTPS1P17812 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CTPS1P17812 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CTPS1P17812 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CTPS1P17812 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CTPS1P17812 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTPS1P17812 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CTPS1P17812 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CTPS1P17812 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CTPS1P17812 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTPS1P17812 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTPS1P17812 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTPS1P17812 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CTPS1P17812 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTPS1P17812 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTPS1P17812 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTPS1P17812 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTPS1P17812 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTPS1P17812 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTPS1P17812 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTPS1P17812 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTPS1P17812 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CTPS1P17812 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTPS1P17812 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTPS1P17812 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTPS1P17812 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTPS1P17812 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CTPS1P17812 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CTPS1P17812 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
CTPS1P17812 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTPS1P17812 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTPS1P17812 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTPS1P17812 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CTPS1P17812 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CTPS1P17812 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTPS1P17812 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTPS1P17812 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTPS1P17812 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTPS1P17812 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTPS1P17812 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTPS1P17812 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTPS1P17812 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTPS1P17812 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CTPS1P17812 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTPS1P17812 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTPS1P17812 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTPS1P17812 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTPS1P17812 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTPS1P17812 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTPS1P17812 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTPS1P17812 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTPS1P17812 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTPS1P17812 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTPS1P17812 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTPS1P17812 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTPS1P17812 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTPS1P17812 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CTPS1P17812 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTPS1P17812 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTPS1P17812 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTPS1P17812 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTPS1P17812 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTPS1P17812 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTPS1P17812 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTPS1P17812 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTPS1P17812 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms