Protein–RNA interactions for Protein: P16949

STMN1, Stathmin, humanhuman

Predictions only

Length 149 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STMN1P16949 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
STMN1P16949 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
STMN1P16949 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
STMN1P16949 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
STMN1P16949 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
STMN1P16949 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
STMN1P16949 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
STMN1P16949 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
STMN1P16949 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
STMN1P16949 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
STMN1P16949 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
STMN1P16949 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
STMN1P16949 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
STMN1P16949 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
STMN1P16949 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
STMN1P16949 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
STMN1P16949 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
STMN1P16949 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
STMN1P16949 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
STMN1P16949 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
STMN1P16949 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
STMN1P16949 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
STMN1P16949 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
STMN1P16949 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
STMN1P16949 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
STMN1P16949 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
STMN1P16949 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
STMN1P16949 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
STMN1P16949 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
STMN1P16949 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
STMN1P16949 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
STMN1P16949 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
STMN1P16949 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
STMN1P16949 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
STMN1P16949 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
STMN1P16949 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
STMN1P16949 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
STMN1P16949 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
STMN1P16949 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
STMN1P16949 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
STMN1P16949 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
STMN1P16949 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
STMN1P16949 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
STMN1P16949 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
STMN1P16949 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
STMN1P16949 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
STMN1P16949 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
STMN1P16949 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
STMN1P16949 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
STMN1P16949 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
STMN1P16949 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
STMN1P16949 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
STMN1P16949 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
STMN1P16949 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
STMN1P16949 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
STMN1P16949 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
STMN1P16949 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
STMN1P16949 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
STMN1P16949 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
STMN1P16949 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
STMN1P16949 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
STMN1P16949 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
STMN1P16949 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
STMN1P16949 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
STMN1P16949 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
STMN1P16949 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
STMN1P16949 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
STMN1P16949 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
STMN1P16949 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
STMN1P16949 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
STMN1P16949 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
STMN1P16949 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
STMN1P16949 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
STMN1P16949 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
STMN1P16949 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
STMN1P16949 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
STMN1P16949 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
STMN1P16949 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
STMN1P16949 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
STMN1P16949 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
STMN1P16949 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
STMN1P16949 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
STMN1P16949 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
STMN1P16949 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
STMN1P16949 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
STMN1P16949 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
STMN1P16949 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
STMN1P16949 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
STMN1P16949 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
STMN1P16949 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
STMN1P16949 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
STMN1P16949 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
STMN1P16949 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
STMN1P16949 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
STMN1P16949 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
STMN1P16949 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
STMN1P16949 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
STMN1P16949 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
STMN1P16949 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
STMN1P16949 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms