Protein–RNA interactions for Protein: P16452

EPB42, Erythrocyte membrane protein band 4.2, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPB42P16452 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
EPB42P16452 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
EPB42P16452 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
EPB42P16452 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
EPB42P16452 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
EPB42P16452 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
EPB42P16452 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
EPB42P16452 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
EPB42P16452 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
EPB42P16452 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
EPB42P16452 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
EPB42P16452 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
EPB42P16452 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
EPB42P16452 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EPB42P16452 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EPB42P16452 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EPB42P16452 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EPB42P16452 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
EPB42P16452 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EPB42P16452 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
EPB42P16452 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EPB42P16452 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
EPB42P16452 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
EPB42P16452 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
EPB42P16452 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EPB42P16452 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EPB42P16452 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EPB42P16452 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EPB42P16452 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EPB42P16452 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EPB42P16452 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
EPB42P16452 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
EPB42P16452 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EPB42P16452 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EPB42P16452 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EPB42P16452 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
EPB42P16452 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EPB42P16452 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
EPB42P16452 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
EPB42P16452 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EPB42P16452 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
EPB42P16452 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EPB42P16452 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EPB42P16452 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
EPB42P16452 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
EPB42P16452 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
EPB42P16452 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EPB42P16452 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
EPB42P16452 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
EPB42P16452 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
EPB42P16452 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
EPB42P16452 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
EPB42P16452 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EPB42P16452 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
EPB42P16452 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
EPB42P16452 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EPB42P16452 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
EPB42P16452 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EPB42P16452 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EPB42P16452 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EPB42P16452 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
EPB42P16452 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
EPB42P16452 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EPB42P16452 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
EPB42P16452 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EPB42P16452 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EPB42P16452 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EPB42P16452 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
EPB42P16452 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
EPB42P16452 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
EPB42P16452 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
EPB42P16452 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
EPB42P16452 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
EPB42P16452 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
EPB42P16452 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EPB42P16452 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EPB42P16452 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
EPB42P16452 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
EPB42P16452 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EPB42P16452 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EPB42P16452 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EPB42P16452 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
EPB42P16452 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EPB42P16452 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EPB42P16452 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
EPB42P16452 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EPB42P16452 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
EPB42P16452 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EPB42P16452 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
EPB42P16452 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
EPB42P16452 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
EPB42P16452 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
EPB42P16452 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EPB42P16452 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
EPB42P16452 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EPB42P16452 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
EPB42P16452 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EPB42P16452 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EPB42P16452 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EPB42P16452 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms