Protein–RNA interactions for Protein: P16383

GCFC2, GC-rich sequence DNA-binding factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCFC2P16383 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GCFC2P16383 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GCFC2P16383 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GCFC2P16383 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
GCFC2P16383 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GCFC2P16383 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GCFC2P16383 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GCFC2P16383 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GCFC2P16383 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
GCFC2P16383 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GCFC2P16383 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GCFC2P16383 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GCFC2P16383 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
GCFC2P16383 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GCFC2P16383 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GCFC2P16383 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GCFC2P16383 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GCFC2P16383 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
GCFC2P16383 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GCFC2P16383 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GCFC2P16383 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GCFC2P16383 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GCFC2P16383 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GCFC2P16383 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GCFC2P16383 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GCFC2P16383 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
GCFC2P16383 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GCFC2P16383 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GCFC2P16383 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
GCFC2P16383 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GCFC2P16383 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GCFC2P16383 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GCFC2P16383 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GCFC2P16383 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GCFC2P16383 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GCFC2P16383 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GCFC2P16383 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GCFC2P16383 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GCFC2P16383 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GCFC2P16383 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GCFC2P16383 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GCFC2P16383 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GCFC2P16383 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GCFC2P16383 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GCFC2P16383 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GCFC2P16383 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GCFC2P16383 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GCFC2P16383 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GCFC2P16383 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GCFC2P16383 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GCFC2P16383 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GCFC2P16383 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GCFC2P16383 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
GCFC2P16383 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GCFC2P16383 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GCFC2P16383 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GCFC2P16383 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GCFC2P16383 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GCFC2P16383 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GCFC2P16383 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GCFC2P16383 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
GCFC2P16383 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
GCFC2P16383 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GCFC2P16383 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
GCFC2P16383 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
GCFC2P16383 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
GCFC2P16383 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
GCFC2P16383 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GCFC2P16383 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GCFC2P16383 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GCFC2P16383 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GCFC2P16383 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GCFC2P16383 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GCFC2P16383 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GCFC2P16383 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GCFC2P16383 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GCFC2P16383 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GCFC2P16383 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GCFC2P16383 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GCFC2P16383 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GCFC2P16383 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GCFC2P16383 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GCFC2P16383 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GCFC2P16383 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GCFC2P16383 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GCFC2P16383 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GCFC2P16383 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GCFC2P16383 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GCFC2P16383 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GCFC2P16383 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GCFC2P16383 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GCFC2P16383 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GCFC2P16383 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GCFC2P16383 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GCFC2P16383 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GCFC2P16383 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
GCFC2P16383 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GCFC2P16383 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GCFC2P16383 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GCFC2P16383 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms