Protein–RNA interactions for Protein: P14222

PRF1, Perforin-1, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRF1P14222 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PRF1P14222 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PRF1P14222 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PRF1P14222 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.79
PRF1P14222 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PRF1P14222 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PRF1P14222 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PRF1P14222 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PRF1P14222 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PRF1P14222 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PRF1P14222 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PRF1P14222 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PRF1P14222 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PRF1P14222 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PRF1P14222 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PRF1P14222 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
PRF1P14222 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PRF1P14222 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PRF1P14222 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PRF1P14222 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC20■□□□□ 0.79
PRF1P14222 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
PRF1P14222 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
PRF1P14222 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PRF1P14222 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PRF1P14222 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PRF1P14222 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PRF1P14222 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PRF1P14222 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PRF1P14222 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PRF1P14222 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PRF1P14222 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PRF1P14222 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PRF1P14222 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PRF1P14222 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PRF1P14222 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PRF1P14222 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PRF1P14222 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PRF1P14222 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PRF1P14222 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PRF1P14222 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PRF1P14222 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PRF1P14222 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PRF1P14222 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PRF1P14222 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PRF1P14222 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PRF1P14222 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PRF1P14222 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PRF1P14222 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PRF1P14222 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PRF1P14222 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PRF1P14222 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PRF1P14222 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PRF1P14222 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PRF1P14222 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PRF1P14222 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PRF1P14222 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PRF1P14222 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
PRF1P14222 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PRF1P14222 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PRF1P14222 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PRF1P14222 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PRF1P14222 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
PRF1P14222 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
PRF1P14222 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PRF1P14222 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PRF1P14222 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PRF1P14222 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
PRF1P14222 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PRF1P14222 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PRF1P14222 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PRF1P14222 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PRF1P14222 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PRF1P14222 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PRF1P14222 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PRF1P14222 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PRF1P14222 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PRF1P14222 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PRF1P14222 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
PRF1P14222 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PRF1P14222 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PRF1P14222 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PRF1P14222 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PRF1P14222 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PRF1P14222 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PRF1P14222 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PRF1P14222 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PRF1P14222 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PRF1P14222 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PRF1P14222 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PRF1P14222 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PRF1P14222 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
PRF1P14222 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PRF1P14222 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PRF1P14222 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PRF1P14222 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PRF1P14222 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PRF1P14222 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PRF1P14222 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PRF1P14222 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
PRF1P14222 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms