Protein–RNA interactions for Protein: P13994

CCDC130, Coiled-coil domain-containing protein 130, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC130P13994 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC130P13994 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC130P13994 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC130P13994 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC130P13994 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC130P13994 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC130P13994 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC130P13994 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC130P13994 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC130P13994 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC130P13994 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC130P13994 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC130P13994 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC130P13994 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC130P13994 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC130P13994 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC130P13994 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC130P13994 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC130P13994 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC130P13994 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC130P13994 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC130P13994 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC130P13994 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC130P13994 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC130P13994 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC130P13994 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC130P13994 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC130P13994 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC130P13994 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC130P13994 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC130P13994 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC130P13994 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC130P13994 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC130P13994 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC130P13994 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC130P13994 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC130P13994 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC130P13994 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC130P13994 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC130P13994 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC130P13994 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC130P13994 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC130P13994 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC130P13994 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC130P13994 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC130P13994 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC130P13994 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC130P13994 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC130P13994 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCDC130P13994 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCDC130P13994 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCDC130P13994 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCDC130P13994 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCDC130P13994 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC130P13994 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC130P13994 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC130P13994 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC130P13994 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC130P13994 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC130P13994 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC130P13994 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC130P13994 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC130P13994 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC130P13994 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC130P13994 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC130P13994 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC130P13994 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC130P13994 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC130P13994 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC130P13994 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC130P13994 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC130P13994 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC130P13994 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC130P13994 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC130P13994 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC130P13994 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC130P13994 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC130P13994 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC130P13994 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC130P13994 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC130P13994 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC130P13994 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC130P13994 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC130P13994 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC130P13994 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC130P13994 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC130P13994 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC130P13994 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC130P13994 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC130P13994 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC130P13994 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC130P13994 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC130P13994 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC130P13994 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC130P13994 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC130P13994 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC130P13994 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC130P13994 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC130P13994 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC130P13994 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms