Protein–RNA interactions for Protein: P13612

ITGA4, Integrin alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA4P13612 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ITGA4P13612 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ITGA4P13612 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ITGA4P13612 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ITGA4P13612 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
ITGA4P13612 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
ITGA4P13612 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ITGA4P13612 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ITGA4P13612 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ITGA4P13612 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
ITGA4P13612 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ITGA4P13612 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ITGA4P13612 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ITGA4P13612 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ITGA4P13612 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ITGA4P13612 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ITGA4P13612 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ITGA4P13612 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ITGA4P13612 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ITGA4P13612 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ITGA4P13612 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ITGA4P13612 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ITGA4P13612 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ITGA4P13612 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ITGA4P13612 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ITGA4P13612 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ITGA4P13612 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ITGA4P13612 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ITGA4P13612 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ITGA4P13612 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ITGA4P13612 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ITGA4P13612 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ITGA4P13612 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ITGA4P13612 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ITGA4P13612 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ITGA4P13612 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ITGA4P13612 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ITGA4P13612 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
ITGA4P13612 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ITGA4P13612 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ITGA4P13612 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ITGA4P13612 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ITGA4P13612 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ITGA4P13612 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ITGA4P13612 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ITGA4P13612 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ITGA4P13612 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ITGA4P13612 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ITGA4P13612 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ITGA4P13612 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
ITGA4P13612 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
ITGA4P13612 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
ITGA4P13612 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
ITGA4P13612 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ITGA4P13612 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ITGA4P13612 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ITGA4P13612 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ITGA4P13612 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
ITGA4P13612 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.51
ITGA4P13612 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
ITGA4P13612 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
ITGA4P13612 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ITGA4P13612 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ITGA4P13612 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ITGA4P13612 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
ITGA4P13612 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
ITGA4P13612 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ITGA4P13612 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ITGA4P13612 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ITGA4P13612 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ITGA4P13612 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ITGA4P13612 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ITGA4P13612 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ITGA4P13612 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ITGA4P13612 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ITGA4P13612 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ITGA4P13612 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ITGA4P13612 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ITGA4P13612 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ITGA4P13612 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ITGA4P13612 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ITGA4P13612 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ITGA4P13612 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
ITGA4P13612 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ITGA4P13612 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ITGA4P13612 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ITGA4P13612 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ITGA4P13612 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ITGA4P13612 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ITGA4P13612 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ITGA4P13612 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ITGA4P13612 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ITGA4P13612 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ITGA4P13612 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ITGA4P13612 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ITGA4P13612 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ITGA4P13612 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
ITGA4P13612 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ITGA4P13612 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ITGA4P13612 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms