Protein–RNA interactions for Protein: P13591

NCAM1, Neural cell adhesion molecule 1, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAM1P13591 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NCAM1P13591 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NCAM1P13591 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NCAM1P13591 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NCAM1P13591 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
NCAM1P13591 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NCAM1P13591 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NCAM1P13591 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NCAM1P13591 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NCAM1P13591 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NCAM1P13591 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NCAM1P13591 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NCAM1P13591 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NCAM1P13591 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NCAM1P13591 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NCAM1P13591 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NCAM1P13591 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NCAM1P13591 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NCAM1P13591 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NCAM1P13591 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NCAM1P13591 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
NCAM1P13591 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NCAM1P13591 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NCAM1P13591 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NCAM1P13591 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
NCAM1P13591 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
NCAM1P13591 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
NCAM1P13591 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NCAM1P13591 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NCAM1P13591 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NCAM1P13591 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NCAM1P13591 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
NCAM1P13591 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NCAM1P13591 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NCAM1P13591 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NCAM1P13591 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NCAM1P13591 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NCAM1P13591 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NCAM1P13591 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NCAM1P13591 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NCAM1P13591 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NCAM1P13591 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NCAM1P13591 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NCAM1P13591 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NCAM1P13591 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NCAM1P13591 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NCAM1P13591 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
NCAM1P13591 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NCAM1P13591 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NCAM1P13591 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
NCAM1P13591 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
NCAM1P13591 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
NCAM1P13591 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
NCAM1P13591 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NCAM1P13591 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
NCAM1P13591 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NCAM1P13591 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NCAM1P13591 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NCAM1P13591 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NCAM1P13591 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NCAM1P13591 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NCAM1P13591 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NCAM1P13591 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NCAM1P13591 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
NCAM1P13591 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NCAM1P13591 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NCAM1P13591 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
NCAM1P13591 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NCAM1P13591 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NCAM1P13591 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NCAM1P13591 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NCAM1P13591 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
NCAM1P13591 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NCAM1P13591 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NCAM1P13591 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NCAM1P13591 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NCAM1P13591 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NCAM1P13591 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NCAM1P13591 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NCAM1P13591 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NCAM1P13591 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NCAM1P13591 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NCAM1P13591 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
NCAM1P13591 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NCAM1P13591 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NCAM1P13591 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NCAM1P13591 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NCAM1P13591 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NCAM1P13591 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NCAM1P13591 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NCAM1P13591 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NCAM1P13591 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NCAM1P13591 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NCAM1P13591 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NCAM1P13591 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NCAM1P13591 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NCAM1P13591 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NCAM1P13591 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NCAM1P13591 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
NCAM1P13591 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms