Protein–RNA interactions for Protein: P13501

CCL5, C-C motif chemokine 5, humanhuman

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL5P13501 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCL5P13501 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCL5P13501 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCL5P13501 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCL5P13501 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CCL5P13501 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCL5P13501 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCL5P13501 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCL5P13501 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCL5P13501 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CCL5P13501 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCL5P13501 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCL5P13501 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCL5P13501 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCL5P13501 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCL5P13501 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCL5P13501 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCL5P13501 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCL5P13501 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCL5P13501 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCL5P13501 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CCL5P13501 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCL5P13501 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCL5P13501 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCL5P13501 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CCL5P13501 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCL5P13501 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CCL5P13501 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCL5P13501 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCL5P13501 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCL5P13501 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCL5P13501 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCL5P13501 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCL5P13501 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCL5P13501 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCL5P13501 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CCL5P13501 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCL5P13501 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCL5P13501 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCL5P13501 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCL5P13501 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCL5P13501 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCL5P13501 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCL5P13501 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCL5P13501 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCL5P13501 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCL5P13501 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCL5P13501 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCL5P13501 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CCL5P13501 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCL5P13501 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCL5P13501 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCL5P13501 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCL5P13501 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCL5P13501 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCL5P13501 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCL5P13501 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCL5P13501 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCL5P13501 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCL5P13501 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCL5P13501 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CCL5P13501 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CCL5P13501 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCL5P13501 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCL5P13501 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCL5P13501 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCL5P13501 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCL5P13501 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCL5P13501 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCL5P13501 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCL5P13501 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCL5P13501 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCL5P13501 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCL5P13501 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCL5P13501 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCL5P13501 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCL5P13501 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCL5P13501 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCL5P13501 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCL5P13501 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCL5P13501 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCL5P13501 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCL5P13501 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCL5P13501 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCL5P13501 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCL5P13501 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCL5P13501 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCL5P13501 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCL5P13501 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCL5P13501 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
CCL5P13501 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCL5P13501 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCL5P13501 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCL5P13501 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCL5P13501 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCL5P13501 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCL5P13501 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCL5P13501 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCL5P13501 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCL5P13501 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms