Protein–RNA interactions for Protein: P13224

GP1BB, Platelet glycoprotein Ib beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GP1BBP13224 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC20.71■□□□□ 0.91
GP1BBP13224 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
GP1BBP13224 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
GP1BBP13224 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
GP1BBP13224 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
GP1BBP13224 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
GP1BBP13224 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
GP1BBP13224 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.91
GP1BBP13224 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
GP1BBP13224 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
GP1BBP13224 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
GP1BBP13224 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
GP1BBP13224 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
GP1BBP13224 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
GP1BBP13224 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
GP1BBP13224 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
GP1BBP13224 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
GP1BBP13224 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
GP1BBP13224 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
GP1BBP13224 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
GP1BBP13224 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
GP1BBP13224 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
GP1BBP13224 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
GP1BBP13224 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
GP1BBP13224 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
GP1BBP13224 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
GP1BBP13224 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
GP1BBP13224 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
GP1BBP13224 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
GP1BBP13224 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
GP1BBP13224 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
GP1BBP13224 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
GP1BBP13224 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
GP1BBP13224 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
GP1BBP13224 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
GP1BBP13224 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
GP1BBP13224 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
GP1BBP13224 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
GP1BBP13224 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
GP1BBP13224 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
GP1BBP13224 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
GP1BBP13224 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
GP1BBP13224 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
GP1BBP13224 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
GP1BBP13224 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
GP1BBP13224 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
GP1BBP13224 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
GP1BBP13224 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
GP1BBP13224 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
GP1BBP13224 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
GP1BBP13224 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
GP1BBP13224 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
GP1BBP13224 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
GP1BBP13224 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
GP1BBP13224 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
GP1BBP13224 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
GP1BBP13224 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
GP1BBP13224 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
GP1BBP13224 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
GP1BBP13224 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
GP1BBP13224 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
GP1BBP13224 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
GP1BBP13224 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
GP1BBP13224 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
GP1BBP13224 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC20.67■□□□□ 0.9
GP1BBP13224 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
GP1BBP13224 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
GP1BBP13224 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
GP1BBP13224 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
GP1BBP13224 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
GP1BBP13224 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
GP1BBP13224 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
GP1BBP13224 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
GP1BBP13224 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
GP1BBP13224 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
GP1BBP13224 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
GP1BBP13224 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
GP1BBP13224 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
GP1BBP13224 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
GP1BBP13224 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
GP1BBP13224 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
GP1BBP13224 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
GP1BBP13224 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
GP1BBP13224 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
GP1BBP13224 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
GP1BBP13224 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
GP1BBP13224 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC20.65■□□□□ 0.9
GP1BBP13224 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
GP1BBP13224 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
GP1BBP13224 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
GP1BBP13224 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
GP1BBP13224 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
GP1BBP13224 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
GP1BBP13224 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
GP1BBP13224 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
GP1BBP13224 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
GP1BBP13224 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
GP1BBP13224 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
GP1BBP13224 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
GP1BBP13224 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms