Protein–RNA interactions for Protein: P12838

DEFA4, Neutrophil defensin 4, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA4P12838 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DEFA4P12838 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DEFA4P12838 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
DEFA4P12838 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DEFA4P12838 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DEFA4P12838 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DEFA4P12838 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DEFA4P12838 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DEFA4P12838 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DEFA4P12838 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
DEFA4P12838 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DEFA4P12838 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DEFA4P12838 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DEFA4P12838 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DEFA4P12838 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DEFA4P12838 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DEFA4P12838 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DEFA4P12838 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DEFA4P12838 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DEFA4P12838 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DEFA4P12838 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DEFA4P12838 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
DEFA4P12838 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
DEFA4P12838 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
DEFA4P12838 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
DEFA4P12838 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
DEFA4P12838 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
DEFA4P12838 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DEFA4P12838 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DEFA4P12838 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DEFA4P12838 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DEFA4P12838 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DEFA4P12838 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DEFA4P12838 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DEFA4P12838 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DEFA4P12838 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DEFA4P12838 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DEFA4P12838 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DEFA4P12838 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
DEFA4P12838 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DEFA4P12838 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DEFA4P12838 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DEFA4P12838 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DEFA4P12838 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
DEFA4P12838 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DEFA4P12838 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
DEFA4P12838 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
DEFA4P12838 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
DEFA4P12838 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
DEFA4P12838 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DEFA4P12838 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
DEFA4P12838 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DEFA4P12838 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
DEFA4P12838 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DEFA4P12838 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DEFA4P12838 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DEFA4P12838 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DEFA4P12838 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DEFA4P12838 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DEFA4P12838 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DEFA4P12838 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DEFA4P12838 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DEFA4P12838 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DEFA4P12838 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DEFA4P12838 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DEFA4P12838 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DEFA4P12838 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DEFA4P12838 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DEFA4P12838 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
DEFA4P12838 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DEFA4P12838 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DEFA4P12838 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DEFA4P12838 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DEFA4P12838 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DEFA4P12838 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DEFA4P12838 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DEFA4P12838 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DEFA4P12838 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DEFA4P12838 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DEFA4P12838 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DEFA4P12838 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DEFA4P12838 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
DEFA4P12838 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DEFA4P12838 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DEFA4P12838 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DEFA4P12838 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DEFA4P12838 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DEFA4P12838 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DEFA4P12838 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DEFA4P12838 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DEFA4P12838 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DEFA4P12838 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DEFA4P12838 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
DEFA4P12838 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
DEFA4P12838 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
DEFA4P12838 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DEFA4P12838 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DEFA4P12838 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DEFA4P12838 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DEFA4P12838 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms