Protein–RNA interactions for Protein: P12830

CDH1, Cadherin-1, humanhuman

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH1P12830 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDH1P12830 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDH1P12830 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CDH1P12830 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDH1P12830 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDH1P12830 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDH1P12830 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDH1P12830 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDH1P12830 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDH1P12830 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDH1P12830 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDH1P12830 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDH1P12830 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDH1P12830 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDH1P12830 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDH1P12830 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDH1P12830 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDH1P12830 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDH1P12830 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDH1P12830 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDH1P12830 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDH1P12830 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDH1P12830 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDH1P12830 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDH1P12830 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDH1P12830 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDH1P12830 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDH1P12830 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDH1P12830 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDH1P12830 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDH1P12830 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDH1P12830 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDH1P12830 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDH1P12830 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDH1P12830 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDH1P12830 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDH1P12830 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDH1P12830 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDH1P12830 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CDH1P12830 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDH1P12830 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDH1P12830 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDH1P12830 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDH1P12830 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDH1P12830 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDH1P12830 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDH1P12830 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDH1P12830 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDH1P12830 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CDH1P12830 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDH1P12830 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CDH1P12830 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDH1P12830 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDH1P12830 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CDH1P12830 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDH1P12830 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDH1P12830 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDH1P12830 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDH1P12830 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDH1P12830 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDH1P12830 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDH1P12830 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDH1P12830 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDH1P12830 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDH1P12830 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDH1P12830 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDH1P12830 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDH1P12830 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CDH1P12830 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDH1P12830 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDH1P12830 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDH1P12830 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDH1P12830 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDH1P12830 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDH1P12830 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDH1P12830 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CDH1P12830 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CDH1P12830 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CDH1P12830 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CDH1P12830 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CDH1P12830 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CDH1P12830 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CDH1P12830 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CDH1P12830 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CDH1P12830 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CDH1P12830 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CDH1P12830 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CDH1P12830 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CDH1P12830 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CDH1P12830 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CDH1P12830 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CDH1P12830 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CDH1P12830 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CDH1P12830 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CDH1P12830 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CDH1P12830 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDH1P12830 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDH1P12830 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDH1P12830 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDH1P12830 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms