Protein–RNA interactions for Protein: P12755

SKI, Ski oncogene, humanhuman

Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIP12755 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SKIP12755 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SKIP12755 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SKIP12755 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SKIP12755 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SKIP12755 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SKIP12755 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SKIP12755 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SKIP12755 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SKIP12755 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SKIP12755 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SKIP12755 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SKIP12755 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SKIP12755 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SKIP12755 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SKIP12755 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SKIP12755 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SKIP12755 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SKIP12755 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SKIP12755 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SKIP12755 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SKIP12755 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SKIP12755 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SKIP12755 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SKIP12755 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SKIP12755 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SKIP12755 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SKIP12755 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SKIP12755 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SKIP12755 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SKIP12755 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SKIP12755 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SKIP12755 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SKIP12755 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SKIP12755 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SKIP12755 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SKIP12755 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SKIP12755 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SKIP12755 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SKIP12755 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SKIP12755 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SKIP12755 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SKIP12755 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SKIP12755 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SKIP12755 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SKIP12755 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SKIP12755 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SKIP12755 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SKIP12755 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SKIP12755 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SKIP12755 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SKIP12755 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SKIP12755 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SKIP12755 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SKIP12755 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SKIP12755 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SKIP12755 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SKIP12755 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SKIP12755 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SKIP12755 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SKIP12755 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SKIP12755 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SKIP12755 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SKIP12755 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SKIP12755 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SKIP12755 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SKIP12755 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SKIP12755 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SKIP12755 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SKIP12755 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SKIP12755 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SKIP12755 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SKIP12755 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SKIP12755 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SKIP12755 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SKIP12755 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SKIP12755 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SKIP12755 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SKIP12755 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SKIP12755 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SKIP12755 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SKIP12755 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SKIP12755 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SKIP12755 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SKIP12755 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SKIP12755 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SKIP12755 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SKIP12755 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SKIP12755 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SKIP12755 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SKIP12755 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SKIP12755 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SKIP12755 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SKIP12755 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SKIP12755 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SKIP12755 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SKIP12755 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SKIP12755 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SKIP12755 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SKIP12755 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms