Protein–RNA interactions for Protein: P12004

PCNA, Proliferating cell nuclear antigen, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNAP12004 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PCNAP12004 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PCNAP12004 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PCNAP12004 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PCNAP12004 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PCNAP12004 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PCNAP12004 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PCNAP12004 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PCNAP12004 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PCNAP12004 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PCNAP12004 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
PCNAP12004 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PCNAP12004 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PCNAP12004 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PCNAP12004 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
PCNAP12004 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
PCNAP12004 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PCNAP12004 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PCNAP12004 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PCNAP12004 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PCNAP12004 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PCNAP12004 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PCNAP12004 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PCNAP12004 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PCNAP12004 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PCNAP12004 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PCNAP12004 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PCNAP12004 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PCNAP12004 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PCNAP12004 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PCNAP12004 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PCNAP12004 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PCNAP12004 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PCNAP12004 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PCNAP12004 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PCNAP12004 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PCNAP12004 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PCNAP12004 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PCNAP12004 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PCNAP12004 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PCNAP12004 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PCNAP12004 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PCNAP12004 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PCNAP12004 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PCNAP12004 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PCNAP12004 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PCNAP12004 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PCNAP12004 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PCNAP12004 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PCNAP12004 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PCNAP12004 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PCNAP12004 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PCNAP12004 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PCNAP12004 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PCNAP12004 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PCNAP12004 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PCNAP12004 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PCNAP12004 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PCNAP12004 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PCNAP12004 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PCNAP12004 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PCNAP12004 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PCNAP12004 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PCNAP12004 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PCNAP12004 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PCNAP12004 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PCNAP12004 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PCNAP12004 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PCNAP12004 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PCNAP12004 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PCNAP12004 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PCNAP12004 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PCNAP12004 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PCNAP12004 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PCNAP12004 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PCNAP12004 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PCNAP12004 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PCNAP12004 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PCNAP12004 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PCNAP12004 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PCNAP12004 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PCNAP12004 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PCNAP12004 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PCNAP12004 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PCNAP12004 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
PCNAP12004 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PCNAP12004 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PCNAP12004 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PCNAP12004 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PCNAP12004 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PCNAP12004 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PCNAP12004 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PCNAP12004 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PCNAP12004 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PCNAP12004 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PCNAP12004 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PCNAP12004 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PCNAP12004 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PCNAP12004 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PCNAP12004 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms