Protein–RNA interactions for Protein: P11488

GNAT1, Guanine nucleotide-binding protein G(t) subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNAT1P11488 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GNAT1P11488 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GNAT1P11488 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GNAT1P11488 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GNAT1P11488 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GNAT1P11488 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GNAT1P11488 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GNAT1P11488 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GNAT1P11488 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GNAT1P11488 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GNAT1P11488 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GNAT1P11488 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GNAT1P11488 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GNAT1P11488 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GNAT1P11488 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GNAT1P11488 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GNAT1P11488 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GNAT1P11488 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GNAT1P11488 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GNAT1P11488 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GNAT1P11488 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GNAT1P11488 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
GNAT1P11488 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GNAT1P11488 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GNAT1P11488 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GNAT1P11488 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
GNAT1P11488 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GNAT1P11488 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GNAT1P11488 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GNAT1P11488 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GNAT1P11488 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GNAT1P11488 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GNAT1P11488 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GNAT1P11488 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GNAT1P11488 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GNAT1P11488 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GNAT1P11488 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
GNAT1P11488 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GNAT1P11488 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GNAT1P11488 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GNAT1P11488 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GNAT1P11488 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GNAT1P11488 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GNAT1P11488 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GNAT1P11488 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GNAT1P11488 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GNAT1P11488 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GNAT1P11488 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
GNAT1P11488 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GNAT1P11488 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GNAT1P11488 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GNAT1P11488 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GNAT1P11488 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GNAT1P11488 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GNAT1P11488 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GNAT1P11488 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GNAT1P11488 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GNAT1P11488 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GNAT1P11488 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GNAT1P11488 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
GNAT1P11488 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GNAT1P11488 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GNAT1P11488 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
GNAT1P11488 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
GNAT1P11488 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GNAT1P11488 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GNAT1P11488 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GNAT1P11488 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GNAT1P11488 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GNAT1P11488 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GNAT1P11488 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GNAT1P11488 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GNAT1P11488 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GNAT1P11488 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GNAT1P11488 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GNAT1P11488 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GNAT1P11488 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GNAT1P11488 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GNAT1P11488 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GNAT1P11488 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
GNAT1P11488 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GNAT1P11488 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GNAT1P11488 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GNAT1P11488 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GNAT1P11488 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GNAT1P11488 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GNAT1P11488 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GNAT1P11488 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GNAT1P11488 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GNAT1P11488 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GNAT1P11488 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GNAT1P11488 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GNAT1P11488 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GNAT1P11488 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GNAT1P11488 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GNAT1P11488 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GNAT1P11488 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GNAT1P11488 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GNAT1P11488 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GNAT1P11488 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms