Protein–RNA interactions for Protein: P11055

MYH3, Myosin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,940 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYH3P11055 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
MYH3P11055 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
MYH3P11055 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
MYH3P11055 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
MYH3P11055 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
MYH3P11055 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
MYH3P11055 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
MYH3P11055 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
MYH3P11055 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
MYH3P11055 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
MYH3P11055 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
MYH3P11055 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
MYH3P11055 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
MYH3P11055 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
MYH3P11055 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
MYH3P11055 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
MYH3P11055 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
MYH3P11055 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
MYH3P11055 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
MYH3P11055 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
MYH3P11055 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
MYH3P11055 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
MYH3P11055 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
MYH3P11055 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
MYH3P11055 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
MYH3P11055 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
MYH3P11055 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
MYH3P11055 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
MYH3P11055 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
MYH3P11055 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
MYH3P11055 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
MYH3P11055 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
MYH3P11055 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
MYH3P11055 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
MYH3P11055 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
MYH3P11055 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
MYH3P11055 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
MYH3P11055 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
MYH3P11055 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
MYH3P11055 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
MYH3P11055 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
MYH3P11055 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
MYH3P11055 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
MYH3P11055 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
MYH3P11055 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
MYH3P11055 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
MYH3P11055 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
MYH3P11055 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
MYH3P11055 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
MYH3P11055 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
MYH3P11055 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
MYH3P11055 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
MYH3P11055 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
MYH3P11055 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
MYH3P11055 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
MYH3P11055 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
MYH3P11055 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
MYH3P11055 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
MYH3P11055 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
MYH3P11055 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
MYH3P11055 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
MYH3P11055 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
MYH3P11055 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
MYH3P11055 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
MYH3P11055 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC27.73■■■□□ 2.03
MYH3P11055 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
MYH3P11055 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
MYH3P11055 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
MYH3P11055 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
MYH3P11055 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
MYH3P11055 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
MYH3P11055 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
MYH3P11055 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
MYH3P11055 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
MYH3P11055 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
MYH3P11055 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
MYH3P11055 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
MYH3P11055 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
MYH3P11055 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
MYH3P11055 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
MYH3P11055 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
MYH3P11055 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC27.71■■■□□ 2.03
MYH3P11055 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
MYH3P11055 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
MYH3P11055 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
MYH3P11055 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
MYH3P11055 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
MYH3P11055 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
MYH3P11055 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.02
MYH3P11055 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
MYH3P11055 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
MYH3P11055 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
MYH3P11055 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
MYH3P11055 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
MYH3P11055 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
MYH3P11055 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
MYH3P11055 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
MYH3P11055 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
MYH3P11055 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
MYH3P11055 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms