Protein–RNA interactions for Protein: P10276

RARA, Retinoic acid receptor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARAP10276 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RARAP10276 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RARAP10276 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RARAP10276 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RARAP10276 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RARAP10276 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RARAP10276 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RARAP10276 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RARAP10276 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RARAP10276 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RARAP10276 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RARAP10276 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RARAP10276 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RARAP10276 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RARAP10276 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RARAP10276 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RARAP10276 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RARAP10276 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RARAP10276 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
RARAP10276 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RARAP10276 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RARAP10276 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RARAP10276 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RARAP10276 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RARAP10276 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RARAP10276 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
RARAP10276 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RARAP10276 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RARAP10276 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RARAP10276 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RARAP10276 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RARAP10276 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RARAP10276 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RARAP10276 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RARAP10276 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RARAP10276 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RARAP10276 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RARAP10276 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RARAP10276 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RARAP10276 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RARAP10276 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RARAP10276 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RARAP10276 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
RARAP10276 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RARAP10276 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RARAP10276 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RARAP10276 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RARAP10276 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RARAP10276 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RARAP10276 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RARAP10276 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RARAP10276 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RARAP10276 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
RARAP10276 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
RARAP10276 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RARAP10276 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RARAP10276 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RARAP10276 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RARAP10276 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RARAP10276 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RARAP10276 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RARAP10276 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RARAP10276 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RARAP10276 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
RARAP10276 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RARAP10276 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RARAP10276 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
RARAP10276 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
RARAP10276 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RARAP10276 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RARAP10276 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RARAP10276 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RARAP10276 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RARAP10276 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RARAP10276 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RARAP10276 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RARAP10276 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RARAP10276 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RARAP10276 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RARAP10276 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RARAP10276 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RARAP10276 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RARAP10276 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RARAP10276 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RARAP10276 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RARAP10276 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RARAP10276 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
RARAP10276 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RARAP10276 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RARAP10276 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RARAP10276 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RARAP10276 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RARAP10276 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RARAP10276 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RARAP10276 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RARAP10276 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RARAP10276 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RARAP10276 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
RARAP10276 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RARAP10276 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms