Protein–RNA interactions for Protein: P0DPA3

SNHG28, Putative uncharacterized protein SNHG28, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG28P0DPA3 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SNHG28P0DPA3 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SNHG28P0DPA3 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SNHG28P0DPA3 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SNHG28P0DPA3 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SNHG28P0DPA3 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SNHG28P0DPA3 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
SNHG28P0DPA3 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SNHG28P0DPA3 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
SNHG28P0DPA3 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
SNHG28P0DPA3 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SNHG28P0DPA3 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SNHG28P0DPA3 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SNHG28P0DPA3 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SNHG28P0DPA3 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SNHG28P0DPA3 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SNHG28P0DPA3 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SNHG28P0DPA3 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SNHG28P0DPA3 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
SNHG28P0DPA3 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SNHG28P0DPA3 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SNHG28P0DPA3 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SNHG28P0DPA3 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
SNHG28P0DPA3 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SNHG28P0DPA3 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
SNHG28P0DPA3 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SNHG28P0DPA3 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SNHG28P0DPA3 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SNHG28P0DPA3 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SNHG28P0DPA3 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
SNHG28P0DPA3 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SNHG28P0DPA3 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SNHG28P0DPA3 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SNHG28P0DPA3 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SNHG28P0DPA3 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SNHG28P0DPA3 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
SNHG28P0DPA3 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
SNHG28P0DPA3 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SNHG28P0DPA3 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
SNHG28P0DPA3 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SNHG28P0DPA3 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SNHG28P0DPA3 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
SNHG28P0DPA3 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SNHG28P0DPA3 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SNHG28P0DPA3 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SNHG28P0DPA3 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SNHG28P0DPA3 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SNHG28P0DPA3 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SNHG28P0DPA3 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SNHG28P0DPA3 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SNHG28P0DPA3 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SNHG28P0DPA3 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SNHG28P0DPA3 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SNHG28P0DPA3 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SNHG28P0DPA3 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SNHG28P0DPA3 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SNHG28P0DPA3 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SNHG28P0DPA3 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SNHG28P0DPA3 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SNHG28P0DPA3 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SNHG28P0DPA3 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SNHG28P0DPA3 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SNHG28P0DPA3 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SNHG28P0DPA3 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SNHG28P0DPA3 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SNHG28P0DPA3 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SNHG28P0DPA3 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SNHG28P0DPA3 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SNHG28P0DPA3 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SNHG28P0DPA3 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SNHG28P0DPA3 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SNHG28P0DPA3 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SNHG28P0DPA3 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SNHG28P0DPA3 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SNHG28P0DPA3 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SNHG28P0DPA3 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SNHG28P0DPA3 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SNHG28P0DPA3 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.72
SNHG28P0DPA3 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
SNHG28P0DPA3 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SNHG28P0DPA3 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SNHG28P0DPA3 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SNHG28P0DPA3 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SNHG28P0DPA3 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
SNHG28P0DPA3 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SNHG28P0DPA3 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SNHG28P0DPA3 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SNHG28P0DPA3 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SNHG28P0DPA3 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SNHG28P0DPA3 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SNHG28P0DPA3 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SNHG28P0DPA3 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SNHG28P0DPA3 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SNHG28P0DPA3 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SNHG28P0DPA3 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SNHG28P0DPA3 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SNHG28P0DPA3 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SNHG28P0DPA3 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SNHG28P0DPA3 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SNHG28P0DPA3 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms