Protein–RNA interactions for Protein: P0DP58

LYNX1, Ly-6/neurotoxin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYNX1P0DP58 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
LYNX1P0DP58 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
LYNX1P0DP58 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
LYNX1P0DP58 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
LYNX1P0DP58 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
LYNX1P0DP58 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
LYNX1P0DP58 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
LYNX1P0DP58 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
LYNX1P0DP58 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
LYNX1P0DP58 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
LYNX1P0DP58 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
LYNX1P0DP58 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
LYNX1P0DP58 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
LYNX1P0DP58 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
LYNX1P0DP58 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
LYNX1P0DP58 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
LYNX1P0DP58 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
LYNX1P0DP58 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
LYNX1P0DP58 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
LYNX1P0DP58 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
LYNX1P0DP58 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
LYNX1P0DP58 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
LYNX1P0DP58 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
LYNX1P0DP58 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
LYNX1P0DP58 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
LYNX1P0DP58 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
LYNX1P0DP58 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
LYNX1P0DP58 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
LYNX1P0DP58 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
LYNX1P0DP58 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
LYNX1P0DP58 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LYNX1P0DP58 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
LYNX1P0DP58 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LYNX1P0DP58 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LYNX1P0DP58 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
LYNX1P0DP58 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
LYNX1P0DP58 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
LYNX1P0DP58 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LYNX1P0DP58 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
LYNX1P0DP58 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LYNX1P0DP58 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
LYNX1P0DP58 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
LYNX1P0DP58 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
LYNX1P0DP58 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LYNX1P0DP58 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
LYNX1P0DP58 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LYNX1P0DP58 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LYNX1P0DP58 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LYNX1P0DP58 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LYNX1P0DP58 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LYNX1P0DP58 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LYNX1P0DP58 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LYNX1P0DP58 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LYNX1P0DP58 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LYNX1P0DP58 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LYNX1P0DP58 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LYNX1P0DP58 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
LYNX1P0DP58 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LYNX1P0DP58 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
LYNX1P0DP58 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LYNX1P0DP58 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LYNX1P0DP58 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LYNX1P0DP58 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LYNX1P0DP58 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LYNX1P0DP58 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LYNX1P0DP58 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LYNX1P0DP58 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LYNX1P0DP58 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LYNX1P0DP58 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LYNX1P0DP58 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LYNX1P0DP58 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LYNX1P0DP58 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LYNX1P0DP58 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LYNX1P0DP58 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
LYNX1P0DP58 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LYNX1P0DP58 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LYNX1P0DP58 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LYNX1P0DP58 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LYNX1P0DP58 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LYNX1P0DP58 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LYNX1P0DP58 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LYNX1P0DP58 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LYNX1P0DP58 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LYNX1P0DP58 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LYNX1P0DP58 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LYNX1P0DP58 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LYNX1P0DP58 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LYNX1P0DP58 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LYNX1P0DP58 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LYNX1P0DP58 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LYNX1P0DP58 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LYNX1P0DP58 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LYNX1P0DP58 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LYNX1P0DP58 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LYNX1P0DP58 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LYNX1P0DP58 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LYNX1P0DP58 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LYNX1P0DP58 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LYNX1P0DP58 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LYNX1P0DP58 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms