Protein–RNA interactions for Protein: P0DP42

TMEM225B, Transmembrane protein 225B, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM225BP0DP42 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMEM225BP0DP42 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMEM225BP0DP42 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMEM225BP0DP42 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMEM225BP0DP42 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMEM225BP0DP42 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMEM225BP0DP42 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMEM225BP0DP42 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMEM225BP0DP42 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMEM225BP0DP42 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMEM225BP0DP42 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMEM225BP0DP42 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMEM225BP0DP42 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMEM225BP0DP42 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
TMEM225BP0DP42 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMEM225BP0DP42 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMEM225BP0DP42 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMEM225BP0DP42 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMEM225BP0DP42 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMEM225BP0DP42 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMEM225BP0DP42 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMEM225BP0DP42 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMEM225BP0DP42 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMEM225BP0DP42 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMEM225BP0DP42 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMEM225BP0DP42 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMEM225BP0DP42 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMEM225BP0DP42 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMEM225BP0DP42 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMEM225BP0DP42 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.66
TMEM225BP0DP42 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
TMEM225BP0DP42 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
TMEM225BP0DP42 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMEM225BP0DP42 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMEM225BP0DP42 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
TMEM225BP0DP42 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMEM225BP0DP42 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMEM225BP0DP42 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMEM225BP0DP42 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMEM225BP0DP42 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMEM225BP0DP42 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMEM225BP0DP42 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMEM225BP0DP42 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMEM225BP0DP42 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMEM225BP0DP42 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMEM225BP0DP42 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMEM225BP0DP42 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMEM225BP0DP42 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMEM225BP0DP42 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMEM225BP0DP42 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMEM225BP0DP42 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMEM225BP0DP42 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
TMEM225BP0DP42 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMEM225BP0DP42 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMEM225BP0DP42 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMEM225BP0DP42 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
TMEM225BP0DP42 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
TMEM225BP0DP42 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMEM225BP0DP42 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMEM225BP0DP42 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMEM225BP0DP42 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMEM225BP0DP42 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMEM225BP0DP42 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMEM225BP0DP42 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMEM225BP0DP42 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMEM225BP0DP42 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMEM225BP0DP42 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMEM225BP0DP42 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMEM225BP0DP42 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMEM225BP0DP42 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMEM225BP0DP42 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMEM225BP0DP42 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMEM225BP0DP42 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMEM225BP0DP42 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMEM225BP0DP42 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMEM225BP0DP42 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMEM225BP0DP42 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
TMEM225BP0DP42 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMEM225BP0DP42 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMEM225BP0DP42 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMEM225BP0DP42 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TMEM225BP0DP42 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TMEM225BP0DP42 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TMEM225BP0DP42 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TMEM225BP0DP42 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TMEM225BP0DP42 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TMEM225BP0DP42 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TMEM225BP0DP42 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TMEM225BP0DP42 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TMEM225BP0DP42 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TMEM225BP0DP42 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TMEM225BP0DP42 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMEM225BP0DP42 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMEM225BP0DP42 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMEM225BP0DP42 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMEM225BP0DP42 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMEM225BP0DP42 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMEM225BP0DP42 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMEM225BP0DP42 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMEM225BP0DP42 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms