Protein–RNA interactions for Protein: P0CB47

UBTFL1, Upstream-binding factor 1-like protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 393 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBTFL1P0CB47 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
UBTFL1P0CB47 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
UBTFL1P0CB47 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
UBTFL1P0CB47 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
UBTFL1P0CB47 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC28■■■□□ 2.07
UBTFL1P0CB47 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
UBTFL1P0CB47 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
UBTFL1P0CB47 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
UBTFL1P0CB47 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
UBTFL1P0CB47 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
UBTFL1P0CB47 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
UBTFL1P0CB47 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
UBTFL1P0CB47 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
UBTFL1P0CB47 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
UBTFL1P0CB47 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
UBTFL1P0CB47 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
UBTFL1P0CB47 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
UBTFL1P0CB47 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
UBTFL1P0CB47 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
UBTFL1P0CB47 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
UBTFL1P0CB47 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
UBTFL1P0CB47 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
UBTFL1P0CB47 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
UBTFL1P0CB47 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
UBTFL1P0CB47 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
UBTFL1P0CB47 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
UBTFL1P0CB47 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
UBTFL1P0CB47 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
UBTFL1P0CB47 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
UBTFL1P0CB47 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
UBTFL1P0CB47 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
UBTFL1P0CB47 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
UBTFL1P0CB47 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
UBTFL1P0CB47 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
UBTFL1P0CB47 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
UBTFL1P0CB47 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
UBTFL1P0CB47 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
UBTFL1P0CB47 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
UBTFL1P0CB47 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
UBTFL1P0CB47 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
UBTFL1P0CB47 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
UBTFL1P0CB47 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
UBTFL1P0CB47 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
UBTFL1P0CB47 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
UBTFL1P0CB47 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
UBTFL1P0CB47 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
UBTFL1P0CB47 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
UBTFL1P0CB47 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
UBTFL1P0CB47 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
UBTFL1P0CB47 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
UBTFL1P0CB47 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
UBTFL1P0CB47 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
UBTFL1P0CB47 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
UBTFL1P0CB47 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.07
UBTFL1P0CB47 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.07
UBTFL1P0CB47 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
UBTFL1P0CB47 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
UBTFL1P0CB47 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
UBTFL1P0CB47 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
UBTFL1P0CB47 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
UBTFL1P0CB47 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
UBTFL1P0CB47 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
UBTFL1P0CB47 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
UBTFL1P0CB47 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
UBTFL1P0CB47 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
UBTFL1P0CB47 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
UBTFL1P0CB47 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
UBTFL1P0CB47 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
UBTFL1P0CB47 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
UBTFL1P0CB47 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
UBTFL1P0CB47 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
UBTFL1P0CB47 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
UBTFL1P0CB47 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
UBTFL1P0CB47 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
UBTFL1P0CB47 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
UBTFL1P0CB47 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
UBTFL1P0CB47 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
UBTFL1P0CB47 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
UBTFL1P0CB47 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
UBTFL1P0CB47 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
UBTFL1P0CB47 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
UBTFL1P0CB47 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
UBTFL1P0CB47 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
UBTFL1P0CB47 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
UBTFL1P0CB47 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
UBTFL1P0CB47 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
UBTFL1P0CB47 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
UBTFL1P0CB47 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
UBTFL1P0CB47 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
UBTFL1P0CB47 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
UBTFL1P0CB47 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
UBTFL1P0CB47 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
UBTFL1P0CB47 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.91■■■□□ 2.06
UBTFL1P0CB47 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
UBTFL1P0CB47 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
UBTFL1P0CB47 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
UBTFL1P0CB47 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
UBTFL1P0CB47 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
UBTFL1P0CB47 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
UBTFL1P0CB47 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms